SONAR-6631 delete RoR concerning custom measures (ex manual measures)

SONAR-6556 remove RoR code of WS projects/ghosts/index and projects/provisioned/index

Fix quality flaws

Add missing annotations

SONAR-6682 Add computation of comment density measures in Compute Engine

Clean PersistMeasuresStepTest
Replace usage of MeasureVariations.setVariation(int, value) by MeasureVariations.setVariation(period, value)
Replace usage of org.sonar.server.db.DbClient by org.sonar.db.DbClient

SONAR-6682 Remove computation of comment density measures from the batch

Filter metrics that can be read from the batch
Only plugin metrics and some defined core metrics are allowed to be read from the batch

Create BiSumCounter to do a sum on 2 metrics

Replace usage of MeasureRepositoryImpl by MeasureRepositoryRule

Move accessors formula to compute engine

Add test with no data on formulas

SONAR-6377 ws plugins/available add homepage and issue tracking URLs

add a type validation module

SONAR-6615 ws custom_measures/search update documentation and tests to include the pending/name/domain fields

SONAR-6610 ws custom_measures/create improve exception management

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-5.1'

Conflicts:
sonar-batch/src/main/java/org/sonar/batch/scan/ProjectScanContainer.java
sonar-core/src/main/java/org/sonar/core/notification/DefaultNotificationManager.java

Merge pull request #403 from SonarSource/feature/fix_notif_manager_preview

SONAR-6673 Do not try to load DefaultNotificationManager in preview mode

SONAR-6572 ws metrics/update metric key format validation

SONAR-6571 ws metrics/create metric key format validation

Show the maven command being used

Use latest version of travis-utils

Revert "Use latest travis-utils"

This reverts commit 0533907055e465dad873e66ef125ac527a11f5d6.

Use latest travis-utils

The test is still unstable

Merge SqlUtil and DatabaseUtils

SONAR-6644 do not compute issue debt if SQALE characteristic is not set

fix quality flaw: method can be static

remove deprecated method MeasureVariations.Builder#setVariation(int, double)

SONAR-6645 rewrite computation of new coverage with Formula

in addition, merge aggregation and computation steps into one

extend Formula to be able to generate more than one measure

SONAR-6709 Simplify RulesDefinition API when two plugins define the same repository

Fix 's' parameter description

Use JDK 7 in Travis-ci

Automatic merge from branch-5.1

* origin/branch-5.1:
  SONAR-6706 org.sonar.api.rules.ActiveRule.getRule().getTemplate() is always null on batch

SONAR-6706 org.sonar.api.rules.ActiveRule.getRule().getTemplate() is always null on batch

SONAR-6704 Exclude the scm-stats plugin from preview analysis

Fix travis.sh script

Don't use travis-utils to start xvfb

Fix travis.sh script

Use latest travis-utils

SONAR-6677 remove coverage Decorators from batch

SONAR-6677 add CoverageMeasuresStep to compute coverage measures

add missing package-info in formula/counter package

MeasureRepoEntry must compare variations value rounded to 1 decimal

this is much more convenient for tests

methods specific to MeasureRepositoryRule should return this

allows to chain methods calls on a specific MeasureRepositoryRule instance

Measure and MeasureVariation must not accept NaN

add Component to contexts in Formula API

also rename context to be more specific
add Component to the API make it more versatile

improve MeasureVariation.Builder

fix VariationValue, avoid the int index pitfall by using the Period class directly

add FormulaExecutorComponentVisitor + variation aggregation support

FormulaExecutorComponentVisitor allows having any step execute Formula
Formula can now do aggregation of MeasureVariation values
also renamed FormulaRepository to CoreFormulaRepository and ComputeFormulaMeasuresStep to CoreMetricFormulaExecutorStep

ComputationStepsTest now use StepsExplorer instead of duplicating code

small javadoc improvement on Period.getIndex()

fix generics declaration in Counter and Formula

Fix issue tracking when comparing only hash of line

Fix travis.sh to execute db tests on mysql and postgres

Move ComponentDao from sonar-server to sonar-db

Remove SearchOptions from ComponentDao

Remove NotFoundExpection from ComponentDao

SONAR-6701 - Drop the db table SEMAPHORES

SONAR-6661 drop the old update center

SONAR-6697 show updated date if available

SONAR-6697 filter available metrics

SONAR-6697 add tests

SONAR-6697 add new custom measures page

SONAR-6615 add metric name and domain to the mandatory response list

Removed PR Analysis from travis

Minor - fix log in PluginInfo

transition coding rules web tests

FIX race condition on LogbackHelper

Reset logback after test

It's not faster and might cause flakiness

cache npm dependencies on travis

Attempt to remove false-positive on LogbackHelperTest

Replace usage of new DbTester() and AbstractDaoTestCase by DbTester.create(System2)

Refactor dao unit tests to use DbTester.create(System2)

fix quality flaws

SONAR-6078 fix tooltips on issues home page

SONAR-6661 apply feedback

Test should be less flaky now

FIX Redundant throws clause

Migrate assert to AssertJ

Unused imports

Fix deprecated code

SONAR-6680 Create step to compute quality profile measure in compute engine

SONAR-6680 Remove quality profile decorator from batch

Replace component ref by component key in error message.
 Component ref doesn't help to know on which component there's an error

Fix visitors when there's many component types of max depth type

Fix QualityGateConditionDaoTest on Oracle

Faster feedback on build error

transition computation web tests

Fix UpdateCenter ITs

Fix UpdateCenter ITs

Fix Flaky test

Get rid of outdated ITs

Fix execution of tests on non-H2 databases

Revert "transition coding rules web tests"

This reverts commit 1e8abae47c4acbbfcebd138074f73bf1f5b111ec.

transition coding rules web tests

Add classes for backward compatibility of plugins/libs (like sonar-license) that are directly calling classes from the core

Revert "Fix execution of tests on non-H2 databases"

This reverts commit 34ac5d84f639df6643a7976593c6f00b4283f04b.

Fix execution of tests on non-H2 databases