SONAR-3060 Use new CPD algorithm

SONAR-3060 Add new CPD algorithm based on suffix tree

SONAR-1974 improve UI+error handling

SONAR-2399 Improvements on review widgets

Fix compatibility of DbUnit with Oracle (lack of boolean type)

Fix creation of Oracle sequences in integration tests of MyBatis

SONAR-1974 add the form to create its own violations

Try to fix Oracle tests

Improve rendering of source code

* remove top and bottom borders from all the line numbers
* remove top and bottom borders from groups of violations
* remove the margin before source code. It can be mixed up with real whitespaces or tabulations in source code

SONAR-3056 do not select line numbers when copying source code

SONAR-3055 API: remove the attribute "classes" of the annotations @DependsUpon and @DependedUpon

SONAR-1974 do not disable the rules of the repository "review" at startup

SONAR-1974 automatically close reviews that relate to resolved manual violations

Remove INFO logs in unit tests and fix Oracle tests

Fix some violations

SONAR-2018 Add rule to detect commented-out lines of code

SONAR-1974 inject manual violations into batch

Fix drilldown page in order to accept the parameter period=0

SONAR-3052 add dependency on Guava 10

SONAR-1974 fix a conflict of column names in the WS /api/violations

Add log to debug integration tests with Oracle

Add missing header + remove hibernate logs when executing unit tests

Fix DaoTestCase for Oracle

We didn't succeed in using java.sql.DatabaseMetaData#getTables() on Oracle.

Table names are not correctly loaded in DaoTestCase

Add logs to DaoTestCase in order to list the TRUNCATE commands

+ Unit tests must log with level INFO

SONAR-1974 add missing change

SONAR-1974 support creation of manual violations in the web service /api/reviews

Improve exception handling of web app when the requested resource does not exist

Fix typo in RuleDaoTest

The field "period_index" of the ruby component Api::DashboardConfiguration should be nil when undefined, but not 0

Rollback incorrect change in sonar.css due to the merge with the branch release-2.12

SONAR-1974 refactor tables RULE_FAILURES and REVIEWS

* Rollback the previous changes on RULE_FAILURES : SNAPSHOT_ID NULLABLE and new column RESOURCE_ID
* Add the columns REVIEWS.RULE_ID (nullable) and MANUAL_VIOLATION (boolean)
* Add experimental MyBatis mapper for reviews
* Add the fields manualViolation (boolean) and permanentId to org.sonar.api.rules.Violation

Allow criteria with null values in DatabaseSession#getResults(Class, Object... criteria)

Escape the value of sonar.jdbc.schema on Oracle

SONAR-2819 Upgrade to PMD 4.3

New rules in PMD 4.3:
* DontCallThreadRun
* GuardDebugLogging

New rules in PMD 4.2.6:
* GenericsNaming
* AvoidCatchingGenericException
* AvoidLosingExceptionInformation
* AvoidLiteralsInIfCondition
* UseConcurrentHashMap
* DoNotHardCodeSDCard

SONAR-3046 change the title when a period is selected + improve links on violation drilldown

SONAR-3045 Guess the property sonar.jdbc.driverClassName

SONAR-1836 Upgrade to Checkstyle 5.5

New rules in 5.2:
* InnerTypeLast

Modified rules in 5.2:
* DeclarationOrder
* ImportOrder

New rules in 5.3:
* OuterTypeFilename
* NestedForDepth
* MethodCount
* OneStatementPerLine

Modified rules in 5.3:
* PackageDeclaration
* MagicNumber
* AbstractClassName
* AvoidStarImport

Modified rules in 5.4:
* UnusedImports
* MagicNumber
* EqualsAvoidNull
* IllegalThrows
* RedundantModifier

Merging from release-2.12 branch

Fix migrations on MSSQL

Remove deprecated calls to org.sonar.api.resources.Project

Fix loading of title in the widget hotspot by metric

SONAR-1974 Add RULE_FAILURES.RESOURCE_ID

SONAR-1974 RULE_FAILURES.SNAPSHOT_ID must be nullable

SONAR-3027 Update the Dependencies Viewer (GWT)

SONAR-3039 Refactor the LCOM4 viewer with Ruby extension

Fix name of CoreMetrics#metrics

Hotspot widgets: complete SQL request + move HTML templates to a dedicated repository

Format source WeightedViolationsDecorator.java

SONAR-3023 Fix migration on MSSQL

Refactoring: WeightedViolationsDecorator should use Settings API instead of deprecated Commons Configuration.

Add factory methods to converters of org.sonar.api.utils.KeyValueFormat

Fix conflict in hotspot_most_violated_rules.html.erb

Release 2.12

SONAR-3033 Bad tooltip for the action "Move right" in the Components page

Remove the italic font from CSS

SONAR-2399 Fix small bug on widget parameter retrieval

=> if the user sets the numberOfLines parameter to blank (''), then
the widget can't be displayed any more.

SONAR-2991 Fix display of total count + remove page size field

SONAR-2399 Improve review widgets

- Make all widgets "differential-view" compliant
- Add bars on the review-per-developer widget
- Fix bug in the link on the the review-per-developer widget
- Fix table display bug on Chrome
- Add description to widget parameters

Remove hardcoded path for MostViolatedRulesWidget

SONAR-3029 compatibility with the widget Most Violated Rules

Fix some violations

Fix some violations

SONAR-2399 Provide some "Reviews" widgets

- My open reviews
- Project open reviews
- False positive reviews
- Number of reviews per developer

Remove unused and incorrect import

SONAR-3029 remove unused l10n translations + fix selection of severity in violations viewer

SONAR-3029 API: allow to have different severities for violations related to the same rule

SONAR-3027 Highlight measure values in headers of viewers

SONAR-2945 Synchronize review title&line with corresponding violation

The message and the line of a violation linked to a review are not
updated in the review detail when the violation changes.

SONAR-3023 Increase the size for column "qualifier" in DB

Tables SNAPSHOTS and PROJECTS.

Reformat schema-derby.ddl and remove unused sonar-test.ddl

SONAR-2897 Support old name for "sonar.cobertura.maxmen"

SONAR-2816 Internationalize numbers displayed in the TimeLine widget

SONAR-2071 Open resource viewer on the correct tab

SONAR-2071 Open resource viewer on the correct tab

Revert the bolding of values in headers of source viewers

Revert the bolding of values in headers of source viewers

Add comment to ChidamberKemererBridge

LCOM4 of Java files without any class - like package-info.java - must be 1

Minor UI improvements : alignment in components header + labels in coverage widget

LCOM4 of Java files without any class - like package-info.java - must be 1

Minor UI improvements : alignment in components header + labels in coverage widget

SONAR-2947 Manually load the right violation for a review

=> the "belongs_to" was causing troubles when running too many
analyses in a small time frame : the source code snippet displayed in
a review detail was not always the last snapshot.

SONAR-2991 Add pagination to the "Reviews" page

SONAR-2972 Remove the + sign before the number of accessors

SONAR-2897 Rename "sonar.cobertura.maxmen" to "sonar.cobertura.maxmem"

SONAR-2975 remove useless connection initialization in ActiveRecord PostgreSQL adapter

The connection is already initialized by Commons DBCP

Remove the field %logger from Logback configuration of Maven plugins

SONAR-2975 fix typo in Oracle ALTER SESSION statement

SONAR-2975 refactor the activerecord configuration

Remove the field %logger from Logback configuration of Maven plugins

SONAR-2975 Rename the property sonar.hibernate.default_schema to sonar.jdbc.schema

MyBatis mappers are refactored at the same time. Schema is not explicitely used in SQL requests anymore. Schema is
automatically handled by the connection pool (commons dbcp) for Oracle and PostgreSQL.

[maven-release-plugin] prepare for next development iteration

[maven-release-plugin] prepare release 2.12-RC2

Remove 2 commented-out lines + add a DEBUG log when excluding plugin

Fix potential NPE in Gradle task

Fix compatibility of file exclusions with the dotnet plugin

Fix loading of Gradle global properties

Fix potential NPE in Gradle task

Fix compatibility of file exclusions with the dotnet plugin