Merge remote branch 'upstream/master'

Improve generated HTML code to make it easier to write Selenium ITs

=> Use of indexes in the table to make it easier to find elements
   (button, input fields, ...)

Fix violations

Fixed some violations

Fix some violations

SONAR-2919 Fix regression introduced on event categories

Simplify MyBatis tests by reusing AbstractDbUnitTestCase

Disable creation of derby.log during execution of unit tests

Do not use commons-configuration in jacoco plugin

SONAR-2317 The metric new lines to cover is badly formated

Cleanup Ruby code (remove useless white spaces).

SONAR-2733 Use new XML format to display duplication groups in Web UI

SONAR-2963 rename some labels and metrics

SONAR-2963 Add the widget "Integration Test Coverage"

Fix the default value of the option :display_scm in the ruby helper SourceHelper#snapshot_source_to_html

SONAR-2733 New XML format to store duplications

Fixed an if-statement without braces violation

SONAR-2962 do not fail if the index already exists

SONAR-2962 Add an index on dependencies.project_snapshot_id to improve performance

Fix unit test

SONAR-2952 add @since comments to new core metrics + remove dead code from jacoco plugin

SONAR-2952 move integration test metrics from jacoco plugin to core

Fix DuplicationDaoTest

Other tests can stuck if connection not closed.

Improve DuplicationDaoTest

SONAR-2952 remove the IT Coverage Tab implemented with GWT

Define JVM memory options in scripts used on developer box

SONAR-2952 Make the coverage tab support integration test measures

SONAR-2958 Null description in the web service "rules"

Deprecate org.sonar.api.utils.Logs

Fix mybatis mapping of DUPLICATIONS_INDEX on Oracle

Improve insertion of rows in DUPLICATIONS_INDEX: use BATCH mode

Increase memory for unit tests with Derby

Improve rendering of duplications tab and add support for IE6

SONAR-2642 Support Oracle DB for cross-project CPD

SONAR-2642 Support MSSQL DB for cross-project CPD

SONAR-2956 Support Boolean type with Derby

- Change DDL to use BOOLEAN instead of SMALLINT
- Modify Hibernate dialect
- Modify activerecord-jdbc-adapter
  (ideas were taken from arjdbc/postgresql/adapter.rb)
- Use Derby for unit tests instead of HSQL and fix incorrect tests

SONAR-2831 Values are not aligned in the page Components

Merge executions of maven-enforcer-plugin

This allows to remove useless messages during build.

SONAR-2932 log exception stacktrace

SONAR-2424 improve error handling of URL /profiles/export

Remove unused logger org.sonar.DBSTATISTICS

SONAR-2914 disable BeanUtils DEBUG logs when sonar.verbose is enabled

SONAR-2642 Support Oracle DB for cross-project CPD

Don't use ping command to test CommandExecutor

This command causes strange problems on Windows 7.

Move the files derby.log generated by unit tests to target/

Minor modifications to make it easier to write ITs

Fix regression on the resource viewer (when no source available)

SONAR-2584 add support for Java7 in PMD

SONAR-2584 add support for Java7 in Checkstyle and Squid

Merge branch 'dups'

SONAR-2733 Fix bug that highlights 2 rows at the same time

=> occurs if a duplication is found in the same file

+ improves code for better performances

SONAR-2698 Display of arrows to sort columns

SONAR-2919 Prevent user from creating twice the same event

- Most importantly for versions
- Check also made on any event
- WS API updated accordingly

SONAR-2642 use MyBatis ScriptRunner + improve unit test logs + prepare migration of hibernate unit tests on derby

Improve boolean parameters of Hibernate HQL queries

Remove useless files (JS and CSS) from WAR

SONAR-2733 Display duplicated blocks by group in the resource viewer

Now waiting for the new table to feed the data that is displayed
by this new duplication tab.

SONAR-2632 Improved the unit test associated to removal of channel buffer length limit

SONAR-2642 Use MyBatis instead of Hibernate for CPD

Revert "SONAR-2594 Fix tests"

This reverts commit 6c0ae292c9d12eaa61b1507831eb9905ea2c6c40.

Revert "SONAR-2594 FindBugs plugin should support localized violations"

This reverts commit 84d96bf6ada999fe22db0551b3e9d56f6605c9bd.

SONAR-2941 Exclude isolated methods from LCOM4 computation

SONAR-2934 Transitive accessor computation now excludes recursive methods

Fix violations

SONAR-2733 Fix unit test and remove useless code

SONAR-2849 Remove declarations of third-party repositories from root pom

Enforce that repositories not declared in pom.xml, except of modules
sonar-checkstyle-plugin and sonar-squid-java-plugin due to dependency
on Checktyle 5.1, which is not available in Central.

This allows to remove side effects in Maven plugins.

SONAR-2733 Display duplicated blocks by group in the resource viewer

First shot, needs improvements.

SONAR-2642 add DAOs to picocontainer + improve unit tests

SONAR-2919 Update purge mechanism

Moved the event deletion from the PurgeEventOrphans class to the
PurgeUtils class that centralizes everything linked to snapshots.

SONAR-1928 Improve performances by splitting the SQL query in 2

SONAR-2642 do not duplicate derby DDL files

SONAR-2919 Fix issues on the event handling

- Make it impossible to create event without a category
  -> created "Other" category
  -> updated both UI and WS (actually: constraint on Event class)
- Fix display issue on Chrome
- Make it impossible to remove version from last snapshot
- Show event widget on sub-projects
- Update purge mechanism to delete events that are not attached to
  a snapshot or attached to an unexisting snapshot

SONAR-2934 Transitive accessor computation now supports recursive methods

SONAR-2580 Use dos-style for line endings in configuration files

SONAR-2937 Disallow start of multiple instances at the same time on Windows

Fix CRLF and remove executable flag for non-executable file

SONAR-2642 improve unit test of mybatis mappers

SONAR-2642 add unit tests

SONAR-2642 first step to integration mybatis

SONAR-2934 Accessors should be considered transitively

Moved the place accessors are computed from a bytecode visitor to a property on the bytecode resource AsmMethod

Fix EmailNotificationChannelTest

* Use SubEthaSMTP instead of Dumbster
* Enable test on Mac OS X

SONAR-2724 SONAR-2723 Improved getter and setter detection algorithm

SONAR-801 Events on Dashboard confused for same project dates

It is now possible to specify 'sonar.projectDate' as a standard
ISO time. (ex. "2011-10-25T10:45:42+0100")

Fix violations

SONAR-2038 Marked a critical violation in Sonar as false-positive

SONAR-2879 Trim paths (sources, tests, binaries, libraries) before usage

SONAR-2038 LCOM4 value is incorrect when mixing getter/setter and direct field access

mend

SONAR-2038 LCOM4 value is incorrect when mixing getter/setter and direct field access

SONAR-2038 LCOM4 value is incorrect when mixing getter/setter and direct field access

SONAR-2796 Display which directories Sonar will use during analysis

* Dedicated Initializer was created in order to do this.
* Exclusions also displayed by this component.

SONAR-2919 Updated WS API for events

SONAR-2919 Remove old useless code

Merge branch 'master' of github.com:SonarSource/sonar

SONAR-2741 The method JavaAstScanner.scanDirectory(..) can't be called several times

SONAR-2928 Fix handling of new violations in case of null checksum

SONAR-2919 Alert/Profile/Version event sensors fill "created_at" col.

SONAR-2919 Update tests of db cleaner

SONAR-2696 On filters, the Name column cannot be sorted on the descending way

SONAR-2695 case-insensitive sort of filter results