Fix quality flaws

Remove unused jruby-openssl

SONAR-4660 Make Settings > 'Database Cleaner', 'Differential Views', 'Duplications', 'Localization' and 'Security' pages, some sub-categories of the 'General' page

SONAR-4045 upgrade to jruby-rack 1.1.13.2

SONAR-4625 Little refactoring of IssuesBySeverity

SONAR-4625 New issues email should contain total issues for each issue type

SONAR-4045 rails does not start if home directory contains whitespace

-> bouncycastle gem/jar not found............... wtf? jruby is supposed to embed open-ssl.

-> removing unused active_resource fixed the issue

SONAR-4628 Move the "Browse" permission before the "Administer" permission

SONAR-4508 Order list of criteria on measures service

Revert "Add package-info files"

This reverts commit 57ebc479a474152480fb23f6c15fc3e288f6fc88.

SONAR-4676 do not insert changelog when issue is new

SONAR-4587 When a SQL error occurs during SonarQube migration, the root SQL cause is sometimes missing

SONAR-4676 Speed-up insertion of new issues in database

Remove duplicated annotation values in IssueTrackingDecorator

SONAR-4617 Refactoring away from Resource<T>

SONAR-4523 delete /extensions/downloads/*.tmp files at startup

Revert "Add package-info files on sonar-batch module"

This reverts commit aae5b839d7dd34fca01312d0c22892f3f43a8054.

Revert "Add package-info files on sonar-core-plugin module"

This reverts commit 5e8d5ce5de4cb4e92c6e0a7cd137a1164989fd74.

Revert "Add package-info files on sonar-plugin-api-module"

This reverts commit da45cd0c58f17c6e57da0eb4f1318b827df90006.

Revert "Add missing package-info files on sonar-server module"

This reverts commit 39cd87c4d76fa97282e43ac6548f2ca87e39ddfa.

SONAR-4499 Replace "method" by "function"

SONAR-4629 Improve check of project key pattern: must not only contain digits

Add package-info files

SONAR-4680 Fix tests

Add package-info files on sonar-batch module

Add package-info files on sonar-core-plugin module

Add package-info files on sonar-plugin-api-module

Add missing package-info files on sonar-server module

SONAR-4680 Module-level settings are not applied on batch side

See SONAR-4643 Deprecate "Depth in Tree" and "Number of Children" design metrics

SONAR-4619 Improve HTML rendering of property descriptions

Refactor definition of exclusion properties

SONAR-4616 Replace "property: value" syntax by "property=value" in configuration files

SONAR-4657 It's impossible to fully delete the extension of a rule description

SONAR-766 Remove string duplication and protect constructor

SONAR-4654 The issue bulk change does not work correctly when paginating

Move settings help to its own div, under save button

SONAR-4659 Create an DB index on 'characteristics.enabled' column

Remove unused Ruby files

Fix unit test on Java 7

SONAR-4045 remove unused rails files

SONAR-4661 Move help section to its own div for clearer separation

SONAR-766 Fix subcategory for coverage exclusions

SONAR-766 Expand coverage on core components

Change property labels for project module (ex|in)clusions

SONAR-766 Add exclusions for coverage

Introduce new API to filter measures before they are saved to context
Implement a measure filter for code coverage measures
Add configuration property for coverage exclusions

SONAR-4045 fix support of Java exception in ruby code

Behavior changed in JRuby 1.7....
http://pivotallabs.com/upgrading-to-jruby-1-7-0/

SONAR-4045 fix zip size on windows

SONAR-4045 Upgrade to JRuby 1.7.4

Update onBulkIssues() calls by removing useless parameters

SONAR-4584 Remove remaining rss template files

Add comment in order to remove specific code for retro compatibility for the SQALE plugin

SONAR-4671 Upgrade MySQL driver to 5.1.26

Upgrade some dependencies

Mainly for unit tests, except http-request (5.2 -> 5.4.1)

SONAR-4653 fix rendering in code viewers

Add the SonarQube version since the dropdown_tag helper is available

SONAR-4656 SONAR-3644 Fix remaining properties labels in exclusions settings

SONAR-4661 SONAR-4655 Fix labels on Exclusions > Duplications properties

SONAR-4661 Fix category name in category help key

SONAR-4661 Display category help on all subcategories

SONAR-4656 Fix documentation labels on sonar.(include|exclude)Modules properties

SONAR-4655 Move CPD exclusions settings to dedicated subcategory of Exclusions

SONAR-3644 Fix issues notified during testing

Fix issue with empty end block pattern
Change labels for batch messages (configuration exceptions)

SONAR-3644 Fix labels and sizes in exclusions settings

Replace 'violations' with 'issues'
Replace 'switch off' with 'ignore'
Double the size of large configuration fields (for regexps/patterns)
Change title of multicriteria property

SONAR-4662 Disable JRuby JMX monitoring by default

Prepare upgrades of JRuby/Rails by upgrading to servlet 3.0

SONAR-4517 fix reloading of page when settings are changed

SONAR-4577 End of support of WAR deployment mode

SONAR-3067 API: remove the deprecated and unused ISO categories

SSF-7

SONAR-4517 fix url

Complete build section of readme

Complete build section of readme

Complete build section of readme

SONAR-4656 Display sonar.includedModules property in configuration

Add core configuration constant for included modules
Declare property in core configuration block
Set indexes on configuration properties

Add build section to readme

Update README.md

Improve README

SONAR-4658 Fix missing CSS class declaration on subcategory description

SONAR-3644 Move 'Exclusions' category to 'Files' subcategory

Migrate file related exclusions configuration to PropertyDefinition API
Introduce 'exclusions.files' subcategory

SONAR-3644 Add l10n keys for issues exclusions subcategory

SONAR-4517 minor change on form action

SONAR-4612 Remove prototypejs from administration console

SONAR-4611 Remove prototypejs from Quality Profiles console

SONAR-4611 Remove prototypejs from Quality Profiles console

SONAR-4612 Remove prototypejs from administration consoles

SONAR-4611 Remove prototypejs from Quality profiles console

SONAR-4517 move components pages to Jquery

SONAR-4517 move dependencies pages to Jquery

SONAR-4517 move settings pages to Jquery

SONAR-4517 clean tabulation indentation on DashBoard pages for a Jquery request

SONAR-3644 Remove obvious issues

SONAR-3644 Get rid of potential NPE issue warning (cannot guarantee that subsequent calls to line() will not return null)

SONAR-3644 Extract constant for documentation link and rename subcategory

SONAR-3644 Remove Constants interface

SONAR-4653 Provide new CSS styles for tables and titles in rule descriptions

SONAR-3644 Add checks for invalid regexps

SONAR-3644 Check input format of configuration entries for multicriteria

SONAR-3644 Reorder configuration properties (allfile > block > multicriteria)

Merge branch 'branch-4.1'

SONAR-3644 Fix issue when matching component key against original file pattern