SONAR-6134, SONAR-6048 Improve performance of FS indexation

Fix compatibility of db tests with non-H2

by removing commit on auto-commit connections

SONAR-6068 Improve performance of FileSystem query operation

issue - update mapper accepting nullable value

fix unit test

fix quality flaws

SONAR-5960 remove CSV from db USERS.SCM_ACCOUNTS

SONAR-2570 compress db table FILE_SOURCES

fix quality flaws

Sanitize README

SONAR-6162 Fix bad merge

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-5.0'

SONAR-6162 Fix NPE when searching for Check of custom rules

SONAR-5183 - timezones - fix timemachine widget on oracle

SONAR-6137 Protect against createdAfter in the future

SONAR-6137 Protect against createdAfter > createdBefore

SONAR-6137 Handle lower bound for createdAt facet when no document match

SONAR-6170 Unresolved issues per assignee is failing to render on removed users

SONAR-6169 Fix lifecycle issue
Previous blame should be loaded after ProjectBuilders are executed

Fix log level

Remove debug code

SONAR-5183 timezones - migrate issues table from timestamp to long

Fix SearchOptions#setPage(int page, int pageSize) when pageSize is zero

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-5.0'

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/batch/ProjectRepositoryLoader.java
server/sonar-server/src/test/java/org/sonar/server/batch/ProjectRepositoryLoaderMediumTest.java
server/sonar-server/src/test/java/org/sonar/server/rule/RuleTesting.java
sonar-batch-protocol/src/main/java/org/sonar/batch/protocol/input/ActiveRule.java
sonar-batch/src/test/java/org/sonar/batch/mediumtest/issues/IssuesMediumTest.java
sonar-batch/src/test/java/org/sonar/batch/mediumtest/issues/IssuesOnDirMediumTest.java

SONAR-6162 Return template rule key in /batch/projects WS

Add missing jdbcType in UserMapper

SONAR-6162 Return template rule key in /batch/projects WS

Refactor issue search stack in order to remove dependency with
SearchRequestHandler

SONAR-5958 Migrate issue filters

SONAR-3566 Make it clear that issue-related information displayed in widgets is desynchronized

SONAR-5950 ignore issue measures

SONAR-5183 timezones - restore Snapshot API

SONAR-5886 apply feedback

Revert "SONAR-6044 Stop storing distribution of issue-related measures by rule"

This reverts commit 217d3d5d39aa5a06828743d11b5a7fab0e10d8f0.

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/db/migrations/DatabaseMigrations.java
sonar-core/src/main/java/org/sonar/core/persistence/DatabaseVersion.java
sonar-core/src/main/resources/org/sonar/core/persistence/rows-h2.sql

Revert "SONAR-6044 Only rule measures should be removed"

This reverts commit 948d046d04e5c8e774857fb8b185af914ddd92cb.

Revert "SONAR-6044 Fix migration on MySQL"

This reverts commit 838feafafc06f752ebd6cabfd467167fa9746404.

SONAR-5183 timezones - fix widgets

SONAR-5820 fix template facet

SONAR-5820 remove old rule permalink

SONAR-6026 apply feedback

SONAR-6044 Fix migration on MySQL

SONAR-5183 timezones - fix views and devcockpit

SONAR-6137 Display full selected range on issues createdAt facet

SONAR-6041 update admin pages layout

SONAR-6089 Fix test

SONAR-6089 Add java doc

SONAR-6089 Only clear lookup cache of current View

SONAR-6089 Clear views cache when indexing views

SONAR-5862 Users should have a way to easily discover that shortcuts exist and understand their scope

Fix compatibility of test AnalysisReportDaoTest with Oracle

Computation - add some tests and filter ComputationStep by project qualifier

SONAR-6089 Only clear lookup cache of current View

SONAR-6089 Clear views cache when indexing views

highlight current selected file on the drilldown page

SONAR-5885 apply feeback

SONAR-6150 It should be possible to select a custom author in the facet on Issues page

SONAR-6150 Search authors in issues index

Fix typo in parameter description

rework css

SONAR-5966 limit the number of suggested tags

SONAR-5345 apply feedback

SONAR-5220 update branding dependency

SONAR-5183 timezones - fix timemachine ruby code

SONAR-6026 Migrate calls to search from widgets to use the new parameters

SONAR-6157 The search of modules should not be available in the Issues page

SONAR-5183 - analysis unsensitive to timezones - update dbUnit test

SONAR-5183 - analysis unsensitive to timezones - snapshots table

SONAR-5893 links from the widget should point to the contextualized issues page

SONAR-5886 improve the creation date facet on the issues page

Remove TimeZone manipulation in unit test

SONAR-6082 fix streching effect

SONAR-6041 apply feedback

SONAR-5789 apply feedback

SONAR-5220 add default home icon

SONAR-6042 add tooltip for unconfirm action

SONAR-5521 fix zero trend icon

Disable ES cache on date-related filters

SONAR-6137 Apply feedback on PR (refactoring of facet processing, tests split)

SONAR-6137 Publish createdAt facet in WS API

SONAR-6137 Use min value from issues when createdAfter is not specified

SONAR-6137 Fix issue with timezone format

SONAR-6137 Use query parameters to compute bucket size

SONAR-6137 Make 0-valued buckets appear in createdAt facet

SONAR-6137 Add basic facet on createdAt, with bucket size = 1 day

Apply feedback from PR #65

SONAR-6044 Only rule measures should be removed

SONAR-6044 Stop storing distribution of issue-related measures by rule

SONAR-5862 Users should have a way to easily discover that shortcuts exist and understand their scope

SONAR-6129 Browser cache must be forcibly reset at each new version of SonarQube

Merge pull request #68 from SonarSource/feature/ajax-errors

SONAR-5946 SONAR-6027 better handling of ajax errors

Fix quality flaws

SONAR-6140 use JVM ciphers by default

SONAR-6082 Improve the coverage markers

SONAR-5820 fix issue with NONE characteristic

Fix compatibility of test AnalysisReportDaoTest with Oracle

SONAR-5345 fix url escaping

SONAR-5820 fix alignment of rule parameters

SONAR-6041 fix scrolling bugs on issues and rules pages

Improve micro-benchmarks of serializers

Improve micro-benchmark of Externalizable