Automatic merge from branch-4.5

* origin/branch-4.5:
  SONAR-5699 Ruby pages are not listed in project sidebar
  Fix timeout issue and speed up UT on my box
  SONAR-5481 Update version of SQ Runner used by internal Maven plugin to 2.4
  Add some javadoc to FilePredicates
  SONAR-5608 Impossible to backup profile when the key contains "+" characters

SONAR-5699 Ruby pages are not listed in project sidebar

Fix timeout issue and speed up UT on my box

SONAR-5481 Update version of SQ Runner used by internal Maven plugin to 2.4

Add some javadoc to FilePredicates

SONAR-5626: Analyze report service

SONAR-5677 Fix support of Git project not at the root of repository tree

SONAR-5608 Impossible to backup profile when the key contains "+" characters

Automatic merge from branch-4.5

* origin/branch-4.5:
  SONAR-5697 Remove E/S response and add exception to log

Fix quality flaw

SONAR-5697 Remove E/S response and add exception to log

SONAR-5643 Unwrap exception to have better error reporting to end user

Merge remote-tracking branch 'remotes/origin/branch-4.5'

Conflicts:
sonar-plugin-api/src/main/java/org/sonar/api/batch/SensorContext.java
sonar-plugin-api/src/main/java/org/sonar/api/batch/sensor/SensorContext.java

SONAR-5697 Remove E/S response and add exception to log

Merge remote-tracking branch 'remotes/origin/branch-4.5'

Conflicts:
sonar-plugin-api/src/main/java/org/sonar/api/batch/SensorContext.java
sonar-plugin-api/src/main/java/org/sonar/api/batch/sensor/SensorContext.java

SONAR-5572 Improve the style of table headers in rule descriptions

SONAR-5570 Improve the hover effect of treemap blocks

SONAR-5584 Increase the default limit of the treemap components

SONAR-5606 Timeline chart does not behave correctly when measures don't have the same history

SONAR-5687 - Slave fails to start if master does not have replication > 0

SONAR-5634 Keep facets and filters in sync, use sticky facets

SONAR-5687 - Added cluster mode which sets replication factor to 1

SONAR-5687 - Added cluster mode which sets replication factor to 1

SONAR-5615 When the DSM is not computed on a module, the page fails to load

SONAR-5616 DSM should show the files dependencies to cut found on modules

SONAR-5631 Activation filter is not correctly set when a quality profile is selected

SONAR-5669 The green color should not be used to identify symbols in the component viewer

SONAR-5612 Disabled users are displayed in global and project permissions page

SONAR-5675 Rename the "Pie Chart" into "Donut Chart"

SONAR-5671 Remove the "Global" tag on the "Measure Filter as Word Cloud" widget

SONAR-5594 The name of a quality profile cannot be blank

Fix merge

Merge remote-tracking branch 'remotes/origin/branch-4.5'

Conflicts:
sonar-plugin-api/src/main/java/org/sonar/api/batch/SensorContext.java
sonar-plugin-api/src/main/java/org/sonar/api/batch/sensor/SensorContext.java

Revert to previous behavior for CommandExecutor::execute for timeout=0

SONAR-5381 SONAR-3350 replace mysql MEDIUMTEXT columns by LONGTEXT

Fix some javadoc

SONAR-5626 find and book next available analysis report

Fix some javadoc

SONAR-5620 Fix missing line with Git

SONAR-5655 Hide "Edit" link on widget while already editing

Fix quality flaws

SONAR-5529 Fix sort by Status in /api/issues/search

SONAR-5620 Minor fixes

SONAR-5656 Add descriptions on pie chart widget properties

SONAR-5617 Update package_design widget

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-4.5'

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/rule/index/RuleIndex.java
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/search/Result.java
server/sonar-server/src/test/java/org/sonar/server/rule/index/RuleIndexMediumTest.java

Fix loading of settings tabs

SONAR-5535 Fix widget path

SONAR-5535 refine layout of size widget (generated_sloc under sloc)

SONAR-5634 - Implemented facets as sticky (multi-select) facets for RuleIndex

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/rule/index/RuleIndex.java
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/search/Result.java

Fix some quality flaws

Fix loading of settings tabs

Fix some quality flaws

SONAR-5620 Fallback to use sonar.links.scm_dev property when no provider is detected

SONAR-5620 No need to exclude SCM Activity since it is blacklisted

SONAR-5535 Fix widget path

SONAR-5643 Properly handle cases where there are local modification on files

SONAR-5677 Fail with a clear message when trying to blame a locally modified file

SONAR-5535 refine layout of size widget (generated_sloc under sloc)

SONAR-5531 Return component id in each issues of /api/issues/search to fix Eclipse ITs

SONAR-5634 - Implemented facets as sticky (multi-select) facets for RuleIndex

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/rule/index/RuleIndex.java
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/search/Result.java

SONAR-5603 Fix display of comments in issue widgets

Fix quality flaw

SONAR-5666 Do not return E/S response in FULL profiling level

Fix some quality flaws

SONAR-5682 drop deprecated PropertyDefinitions#getPropertiesByCategory()

Automatic merge from branch-4.5

* origin/branch-4.5:
  Fix administration section in webapp

Fix administration section in webapp

SONAR-5634 - Implemented facets as sticky (multi-select) facets for RuleIndex

SONAR-5634 - Implemented facets as sticky (multi-select) facets for RuleIndex

SONAR-5548 - Moved ES analyzer definition to indices rather than to node configuration (permits node transport)

SONAR-5686 - Updated settings for IssueIndex to 4 shards

Merge remote-tracking branch 'remotes/origin/branch-4.5'

Conflicts:
plugins/sonar-xoo-plugin/pom.xml
sonar-plugin-api/pom.xml
sonar-plugin-api/src/main/java/org/sonar/api/config/Settings.java

Code clean-up

* mark JFreechart as deprecated
* complete some javadoc

SONAR-5473 Fix fake project referential implementaion

SONAR-5620 Improve user experience

SONAR-5642 Log cleanup

Log cleanup

SONAR-5626 get next report mecanism dao implemented and interfaces defined. Thread management stub.

SONAR-5643 Hide SVN password and rework logging

SONAR-5643 Provide a default SVN SCM Provider

SONAR-5677 Provide JGit implementation

SONAR-5620 Don't fail build when no provider is detected

SONAR-5645 Blacklist SCM Activity plugin

SONAR-5473 Fix fetching of remote SCM data

SONAR-5644 Rework SCM API

SONAR-5642 Initial work on Git provider

SONAR-5644, SONAR-5473 Create new SCM extension point and fetch SCM data using WS

SONAR-5672 Fix regression with measure duplication_lines_data

SONAR-5558 Add licence info, update WS API label

SONAR-5535 Fix missing l10n keys in size metric

SONAR-5658 Add a new field to index severities ordinal

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/issue/index/IssueNormalizer.java

SONAR-5663 Fix issue when updating provisioned project key

SONAR-5663 Reindex issues when renaming a project Key

SONAR-5603 Remove useless select methods using IssueQuery in IssueDao

Fix wrong commit

SONAR-5603 Get issues from E/S in Unresolved Issues per Assignee widget

Conflicts:
server/sonar-server/src/test/java/org/sonar/server/issue/index/IssueIndexMediumTest.java

SONAR-5529 Move IssueQuery from api to server

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/issue/index/IssueIndex.java

SONAR-5529 Remove IssueFinder API and all related classes

Fix merge