SONAR-5884 Clean up

SONAR-5884 Update tests after refactoring

SONAR-5884 Apply feedback, finish refactoring

SONAR-5941 add component key

SONAR-5941 add tests measure and fix number of issues

SONAR-5941 Update /api/components/app

SONAR-5939 delete report at the end of the analysis

SONAR-5910 remove temporary log

Fix some quality flaws

Fix Clirr configuration

Fix Clirr configuration

Configure Clirr

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5753 Save empty string instead of null for root projects
  Remove wront comment about file.encoding=UTF-8 in sonar.properties

SONAR-5820 Ability to do a text search on rule descriptions and titles

Fix quality flaws

SONAR-5959 Change behavior of component-related issue search queries

SONAR-5954 Fix descriptions of component(Key|Uuid)s and moduleUuids

SONAR-5959 Add onComponentOnly parameter to IssueQuery

SONAR-5753 Save empty string instead of null for root projects

SONAR-5820 Ability to "Show only" or "Hide" template rules

SONAR-5820 When there is no rules matching the search criteria, a "No Coding Rules" message should be displayed

Remove wront comment about file.encoding=UTF-8 in sonar.properties

SONAR-5922 Make the difference between default rule severity and activation severity more obvious

SONAR-5607 Make it possible to sort unit tests by status

Adjust timeout of IssueIndexBenchmarkTest

SONAR-5820 Ability to filter rules that are inactive in a quality profile

fix quality flaws

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-5.0'

SONAR-5753 moduleUuidPath of foot projects should be empty instead of NULL

SONAR-5820 Fix display of rule permalink

fix - close connection in unit test

SONAR-5910 SONAR-5911 decompress report and deactivate issues persistence on server side

Revert "Revert "SONAR-5911 persist issues on server side""

This reverts commit e6bf968753bf2ec666aff3d802fa23c40ead8832.

SONAR-5820 Ability to create, edit and delete a "Manual" rule

Fix some quality flaws

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  Improve ComponentTesting and SnapshotTesting

Improve ComponentTesting and SnapshotTesting

SSF-10 Prevent Clickjacking

SONAR-5997 Upgrade Tomcat from 7.0.54 to 7.0.57

Improve stability of randomly allocated ports (when sonar.web.port or sonar.search.port are set to zero)

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5849 Improve the way to get modules tree by using components.moduleUuid

SONAR-5849 Improve the way to get modules tree by using components.moduleUuid

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5849 Performance issue of Project Referentials WS for project with many modules
  SONAR-5849 Extract logic from ProjectReferentialsAction to ProjectReferentialsLoader

SONAR-5849 Performance issue of Project Referentials WS for project with many modules

SONAR-5849 Extract logic from ProjectReferentialsAction to ProjectReferentialsLoader

Revert "SONAR-5911 persist issues on server side"

This reverts commit 0315dec02e79f8fc3f59d4e7d83710b02dc6735b.

Fix quality flaws

SONAR-5820 Fix display of quality profiles

SONAR-5820 Add tooltips

Fix quality flaws

SONAR-5820 Hide details when refine search

Improve modal view ui

Add modal form view

Fix select of facet values

SONAR-5820 On "template" rules, make it possible to create "custom" rules

SONAR-5820 Display the list of custom rules created from a template rule

Fix quality flaws

SONAR-5820 Provide a permalink on each rule description

SONAR-5820 Add query filter

Fix quality flaws

SONAR-5820 Add activation severity filter

SONAR-5820 Add inheritance filter

Add less, coffee, hbs files to analysis

SONAR-5911 persist issues on server side

SONAR-5911 refactoring digest report steps

purge – specify contract method

SONAR-5820 Show "DEPRECATED" label in the list

SONAR-5820 Add "available since" filter

SONAR-5820 Sort by name by default

SONAR-5820 Fix scrolling issues

SONAR-5820 Fix profile activation

SONAR-5820 Complete rule details with sqale metadata

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5995 Remove log on memory leak generated by ProgressLogger when stopping the server

SONAR-5995 Remove log on memory leak generated by ProgressLogger when stopping the server

Revert "SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit"

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5967 Remove the limitation of 3000 lines
  SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit
  SONAR-5817 Fix max number of lines to 500000
  SONAR-5971 The component viewer, in differential mode, might display some unexpected issues

SONAR-5967 Remove the limitation of 3000 lines

SONAR-5820 Update MTs

SONAR-5820 Add quality profiles

SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit

SONAR-5817 Fix max number of lines to 500000

SONAR-5971 The component viewer, in differential mode, might display some unexpected issues

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SSF-26 Cross-Site Scripting on Manual Metrics

SSF-26 Cross-Site Scripting on Manual Metrics

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-5.0'

Conflicts:
server/sonar-web/src/main/js/tests/e2e/views/issues.jade

SSF-25 SMTP configuration password

Revert "SSF-25 SMTP configuration password"

This reverts commit 181538a6d0884e74beec8ad6aa3dcf460baec5ea.

SONAR-5820 Improve the rule description formatting

SSF-25 SMTP configuration password

use byte[] instead of a stream when inserting a report in database

Invalidate browser cache for issues app

Fix display of debt characteristic in the issue rule modal

SONAR-5820 Create a new coding rules page

Fix issue when publishing components on Views

SONAR-5972 A plugin can't declare a quality profile related to a language which is not installed

Fix ordering in issue filter migration test

SONAR-5970 Have tag changes appear in email notification

SONAR-5958 Rename parameters used in issue filters

SONAR-5935 Consider "set_tags" as one of the default actions (not shown in "More")

Fix some quality flaws