Fix quality flaws

SONAR-5595 When analysing a new multi modules project, permission should not be set on module

SONAR-5711 Validate custom rule parameters at creation

SONAR-6009 Each time the batch call the project referentials WS, a E/S query is executed for each rule

SONAR-5552 Display how many files are excluded from the analysis

Replace isUnitTestClass by isUnitTestFile

fix duplications popup

fix file dashboard

update all projects page

fix dashboard configuration

fix header clipping effect

Merge branch-5.0

Move CPD properties to make them back into UI

SONAR-6187 Nothing should be done when there's no characteristic in db

Merge branch-5.0

SONAR-5931 Cleanup dependency API

SONAR-6176 Display DSM even when there is no dependency

change the default facets on the issues page

SONAR-6187 Enhance SQALE model with new characteristics

SONAR-6163 - timezones - events migration

focus the first input in the rule activation modal

fix syntax highlighting

fix issue box status truncation, fix assign to me action

highlight non-ready status of rules

open rule details by dbl click

fix double help modal

SONAR-6079 A license might be displayed as expired even though it's not the case

SONAR-6084 Fix message when using invalid branch name

SONAR-5998 If the per_page is invalid, the size of returned pages is 0

SONAR-6179 Add serverID to the logs of the analysis

SONAR-6190 Dumping profiler info into a file fails when module key contains a colon

SONAR-5886 make bars clickable

SSF-31 XSS and link injection on "role" param of /roles/edit_users and /roles/edit_groups

Add tooltips for source markers

SONAR-5998 If the per_page is invalid, the default value is now returned

SONAR-5999 Check that params are valid integer

SONAR-6000 Truncate duplication data to avoid exceeding persistit cache max size

SONAR-6023 Use summarized version for ES bulk request profiling

SONAR-6024 Show query details on delete by query requests

SONAR-5521 apply feedback

SONAR-6191 Do not allow to copy unsaved filter

SONAR-5820 apply feedback

SONAR-6068 Make persisit iterators "reusable"

SONAR-6146 clean up /resources/index

SONAR-5521 apply feedback

SONAR-5886 apply feedback

SONAR-5953 do not show directories facet when using the contextualized issues page for a directory

SONAR-5966 fix plugin actions

SONAR-6000 Try to decrease size of duplications in persistit

SONAR-6000 Merge cpd core plugin into the batch

SONAR-6003 Add inline documentation for api/resources WS response

SONAR-6004 Apply project permissions on global dashboards

SONAR-6058 Prevent purge of coverage related data in past snapshots

Remove unstable test source-viewer-spec.js

Fix quality flaws

SONAR-6076 Fix directory path on issues directly set on a directory

Speed-up build

SONAR-6147 Update message when resolution was empty

Add configuration for check of dep vulnerabilities listed in CVE registry

SONAR-6117 ComponentDto.isRootProject() should not used module uuid path

Use EsTester in all ProxyXXXTest classes

Try to stabilize unit test

SONAR-6123 Update generation of module UUID path on views and developers

SONAR-6122 Update /batch/projects WS with new module UUID path

SONAR-6121 Simplify ES requests on module path

SONAR-6118 Module UUID path on projects and modules must contain the component itself

SONAR-6120 Change indexation of "module" attribute on issues

SONAR-6119 Handle orphan components

SONAR-6119 Move module UUID path migration, include self on parents

SONAR-6172 Do not fail when a file has no blame information

SONAR-6172 Do not fail when a file has no blame information

Used SortedMap as cache for FS to have consistent order in FS queries

SONAR-6110 Drop support files for Linux PPC 64

SONAR-5998 Fix pagination to manage null pageSize

Fix NPE in erlang plugin

Fix quality flaws

Fix regression in issue tracking

SONAR-6177 Improve /api/projects/create documentation on branch parameter

SONAR-5183 timezones - fix timeline widget

SONAR-6055 Embed latest Findbugs Plugin 3.x

SONAR-5999 Fail to render profile comparison page when parameter id1 is declared as an array

SONAR-5998 Fail to render the measures page when the parameter pageSize does not contain an integer

SONAR-6091 /api/source/hash WS should need "Browse" permission instead of "Code Viewer" permission

Ignore source file information that is set on an unknown line

Improve microbenchmark templates

SONAR-6182 Log a warning when unmappable character is detected in a file

Replace some none static call to DbTester by static call (when possible)

Replace none static call to EsTester and DbTester by static call (when possible)

Add unit tests

Fix quality flaws

Use 4.5.2 as a reference for Clirr comparison report

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-5.0' into fix/merge-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-6130 fix deadlock during purge

Conflicts:
sonar-core/src/main/java/org/sonar/core/purge/PurgeDao.java
sonar-core/src/test/java/org/sonar/core/purge/PurgeDaoTest.java

Fix some possible NPE

Restore deprecated methods on Resource API

manual_measures - fix mapping in ruby code

Fix SourceIndexBenchmarkTest as indexing was improved (some fields are not searchable at all)

SONAR-6131 Measure drilldown is failing on removed components

SONAR-6132 Dashboard is failing on removed components

SONAR-6168 Only "Administer System" permission should be need to create a group

SONAR-6069 Fix redirection of drilldown/issues to /issues