clean analysis_report web services documentation and declare internal use

SONAR-5845 Add a rule overlay

SONAR-5827 Fix corner cases with highligthing offset conversion

Fix duplication markers

SONAR-5845 Feedback applied

SONAR-5827 Fix issue on Oracle (null vs empty string)

SONAR-5827 Feed the new "file_sources" table

 SONAR-5778 Embed Java Plugin 2.6

Automatic merge from branch-4.5

* origin/branch-4.5:
  SONAR-5860 Disable SSLv3 in Tomcat connector

 SONAR-5860 Disable SSLv3 in Tomcat connector

SONAR-5818 add todo for futur use of ProjectSettings class

SONAR-5826 Revert to (get|set)Bytes to please Oracle, refactor migration test to please H2

SONAR-5628 add medium test

SONAR-5718 Improve readability of issues list

Synchronize database and ES with a journal approach

Refactor the way to declare ES indices.

- BaseIndex has too many responsibilities
- SearchClient must not override TransportClient, else it can't be easily used in tests

Fix quality flaws

SONAR-5826 Fix handling of boolean values in migration of source

SONAR-5826 Fix migration of source code when DB is empty

SONAR-5826 Migrate sources and SCM data to file_sources

SONAR-5718 Add debt icon

SONAR-5718 Feedback applied

SONAR-5718 Add issues MT

SONAR-5718 Add issue box tests

SONAR-5718 Fix help closing

SONAR-5718 Fix clipping effect of the black header

SONAR-5718 Disable pointer events during scroll

SONAR-5845 Fix displaying of the project name

SONAR-5845 Add rule permalink

SONAR-5845 Enable issue message escaping

Fix black header overlapping

SONAR-5718 Different fixes

SONAR-5718 Update the font

SONAR-5845 Update the layout and tune the UI of the issue box

Automatic merge from branch-4.5

* origin/branch-4.5:
  SONAR-5610 Fix chrome freezes on the components page

Add some issues perf test on queries

Add periodic rate when inserting issues in E/S

improve code coverage of DataCleaner classes

SONAR-5666 Remove useless {:} in ES search query

Fix quality flaws

SONAR-5610 Fix chrome freezes on the components page

SONAR-5712 Re-merge package_design widget into file_design

fix quality flaws and refactorings

Fix test

Computation: propagate the same session object everywhere
  to avoid DB lock (avoid nested session)

Add counter on issues performance tests

Improve Issues Injection test

fix views plugin large tests failing

it was linked to asynchronous switch in the compute engine. Views datacleaner (batch side) could be launched before than the snapshot switch happened on the server side. It's a temporary hack waiting for next views plugin release (which won't call the PurgeTask#purge(...) method anymore)

Remove temporary infinite timeout on upload_report now it's back to be asynchronous

SONAR-5672 Fix graph test

SONAR-5672 Don't save DSM when there is no dependency or more than 200 components

SONAR-5672 Decrease memory comsumption when working on very big DSM with empty cells

SONAR-5718 Fix bulk change permission

Read perf assertions from properties, add test on index injection

 SONAR-4950 Fix UT

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-4.5'

Conflicts:
sonar-core/src/main/java/org/sonar/core/persistence/DatabaseVersion.java
sonar-core/src/main/resources/org/sonar/core/persistence/rows-h2.sql

SONAR-5718 Add an unplanned option

SONAR-4950 Add missing unique index in the H3 schema

Replace MT by UT

SONAR-5814 Simplify migration based on MassUpdate

SONAR-5718 Fix display of widget on global page

SONAR-4950 update the users.updated_at in order to block other sessions

SONAR-5844 Profile inheritance is always displaying '0 rules' whatever the content of Profiles

SONAR-4950 update the users.updated_at in order to block other sessions

SONAR-5780 Show "Unassigned" even when count == 0

SONAR-5805 Add "Not planned" item to action plans facet

SONAR-5844 Profile inheritance is always displaying '0 rules' whatever the content of Profiles

SONAR-5718 Select issue by mouse

Remove class TxtWriter

SONAR-5623 SONAR-5627 Update UI of the admin page

Speed-up db tests

Set different severity, status and resolution in issues

Add new perf test on issues extraction

Add empty constructor

SONAR-5718 Fix issues shortcuts

SONAR-5825 Create DB structure to store file oriented data

SONAR-5666 SONAR-5697 replace medium tests by small tests

SONAR-5718 Fix facets with search input

SONAR-5742 Fix visibility condition for extra fields (check is already done underneath for actions/transitions)

Fix coding rules modals

SONAR-5718 Fix display of the issues help

SONAR-5718 Add an ability to go to the source and back by mouse

Attempt to increase stability of StopperThreadTest on slow boxes

SONAR-5810 replace param componentRootUuids by projectUuids

Increase stability of MonitorTest on slow boxes

Re-enable randome execution of tests

SONAR-5718 Add languages to the rule facet

SONAR-5718 Add module criteria, update widgets

SONAR-5600 Improve the format of the creation date label

SONAR-5718 Add qualifier icons to the workspace header

SONAR-5718 Improve rendering when there is no results

SONAR-5718 Add a language name for the rule search dropdown

SONAR-5718 Improve creation date facet

SONAR-5718 Add components from componentRootUuids to ref data in issues WS

SONAR-5748 Add language key and name (when known) on rules in issues WS

SONAR-5843 Use the original SVN author on merges

Re-enable IssueAuthorizationDaoTest

SONAR-5666 SONAR-5697 Add missing DeleteByQuery

Fix execution of web medium tests

SONAR-5718 Add basic medium tests