SONAR-5531 - Fix IssueServiceMediumTest

SONAR-5531 - Fix IssueServiceMediumTest

SONAR-5531 - Implemented Synchronization in IssueStorage on Server side

SONAR-5531 - Override save in ServerIssueStorage

SONAR-5614 Do not create default project permissions on first analysis

SONAR-5613 Update Issues Authorization Index when deleting a project

Merge branch 'branch-4.5'

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/db/migrations/DatabaseMigrations.java
sonar-core/src/main/java/org/sonar/core/persistence/DatabaseVersion.java
sonar-core/src/main/resources/org/sonar/core/persistence/rows-h2.sql

SONAR-5580 Migration issue to SQ 4.4 when the quality profile used to analyze the last version of a project has been removed before the migration

SONAR-5614 Create project permissions and synchronize project issues

Improve test coverage

SONAR-5560 - Updated Logs

fix quality flaws

fix quality flaws

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-4.5'

SONAR-4898 improve (again) stability of WatcherThreadTest

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-4.5'

Conflicts:
server/sonar-process-monitor/src/test/java/org/sonar/process/monitor/WatcherThreadTest.java

SONAR-4898 improve (again) stability of WatcherThreadTest

SONAR-4898 improve stability of WatcherThreadTest on slow machines

Add jacoco_build.sh

SONAR-4898 fix quality flaws

SONAR-4898 improve stability of WatcherThreadTest on slow machines

Add jacoco_build.sh

SONAR-4898 fix quality flaws

SONAR-5566 Use existing session for indexing issue permission

SONAR-4898 fix merge of branch-4.5

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-4.5'

Conflicts:
server/process/pom.xml
server/process/sonar-process/src/main/java/org/sonar/process/MonitoredProcess.java
server/sonar-process-monitor/pom.xml
server/sonar-process/pom.xml

SONAR-4898 simplify MonitoredProcess implementations

SONAR-4898 add timeout to RMI calls on isReady()

fix quality flaws

fix quality flaws

SONAR-4898 add timeout to RMI calls on isReady()

SONAR-4898 add debug logs

Fix quality flaw

SONAR-4898 add debug log

SONAR-5566 reindex issues permission only for the project

SONAR-5561 Fix query on Oracle

Create SnapshotTesting

fixed BaseDaoTest by truncating table after test

BaseDao testing for DAO v. 2 0 added actionCount for testing

SONAR-5560 - fixed getByKeys for nullables

BaseDao testing for DAO v. 2 0 added actionCount for testing

BaseDao testing for DAO v. 2 0 SynchronizeAfter

SONAR-4898 delete directory server/process

Merge branch 'process-monitoring' into branch-4.5

SONAR-4898 refactor process monitoring

SONAR-5560 - updated BaseDao for synchronizer params

SONAR-5604 Fix dependency injection when using old versions of the Maven plugin

SONAR-5389 Add a new dependency API

SONAR-5618 Close session after use in ComponentDataPersister

BaseDao testing for DAO v. 2

BaseDao testing for DAO v. 2

BaseDao testing for DAO v.2

SONAR-5614 Create stub of WS /batch/upload_report

SONAR-5529 Create SnapshotDao in order to more easily do some medium tests

rename package org.sonar.server.component.persistence to org.sonar.server.component.db

SONAR-5566 Replace usage of ComponentDao.getByKey by ComponentDao.getAuthorizedComponentByKey

SONAR-5566 Fix test on MySQL 5.6

Add some unit tests

SONAR-5566 Fix issue when updating a lot of permissions

Add missing license headers

Fix some quality flaws

SONAR-5566 When provisioning a project, changing the roles/permissions on a project, the issue_project_permissions index should be updated accordingly

SONAR-5561 Only synchronize issue permission index since last indexation was done

SONAR-5604 Fix JSON of dependency injected by old Maven plugin

Add logs to ease profiling of preview mode when downloading previous source code

Update documentation.

SONAR-5530 - Using *Finders for context objects in IssueResult

SONAR-5530 - Using *Finders for context objects in IssueResult

SONAR-5561 Fix issue on Oracle

Fix license header

SONAR-5604 Design plugin should no more rely on Maven APIs

Remove poc in Issue Authorization in E/S

SONAR-5563 Apply a permission filter when searching for issues in ES

SONAR-5530 - Using *Finders for context objects in IssueResult

SONAR-5560 - Fixed UserDao getUserByLogin with no session

SONAR-5561 - removed some debug output

Merge branch 'master' into issues-in-es

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/db/DbClient.java
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/issue/db/IssueAuthorizationDao.java

SONAR-5530 - Added methods to insert context objects

SONAR-5561 New migration task at start-up to feed ES with issue_project_permissions

SONAR-5561 Create query to load issue authorization from db

fix mistake (should not have been commited)

SONAR-5530 - Added session to UserDao (avoiding nested fetch)

SONAR-5530 - Fetching context objects for IssueResult

SONAR-5530 - fixed debug output

Revert "SONAR-5604 Design plugin should no more rely on Maven APIs"

This reverts commit cc3cabc3e7aa9c1467d2994ef78ae38c16f2e0dd.

SONAR-2860 Fix "Project is not yet initialized" error (lifecycle issue)

SONAR-5530 - Implemented getByKeys in BaseIndex

SONAR-5530 - Implemented getByKeys in BaseIndex

quality flaw removed todo

SONAR-5604 Design plugin should no more rely on Maven APIs

fix null pointer exception

SONAR-5560 - Lock Log to no replica for now

SONAR-5560 - enabled scrolling for synchronizer

SONAR-5560 - removed output

SONAR-5560 - Fixed mapper param name (must be date)

SONAR-5560 - Updated BaseDao to scroll during synchronization

SONAR-2860 Drop one remaining use of commons configuration

SONAR-5601 - remove createdAt comparison in backend test

SONAR-5601 - Fixed IssueWs CTor for tests and es/legacy switch

SONAR-5601 - Updated ServerComponent CTor with types for Properties and Platform