SONAR-9981 Upgrade Elasticsearch to 5.6.3

SONAR-9931 warn if sonar.cpd.cross_project is used in the compute engine

SONAR-9931 deprecate sonar.cpd.cross_project property

fix description of api/qualityprofiles/search

SONAR-9905 Notification daemon must not be started twice

SONAR-8303 Create new rule from template with custom rule type

SONAR-8303 Add type parameter to WS api/rules/create

Fix quality flaws

Travis - support analysis of PR based on PR

Automatic merge from branch-6.6

* origin/branch-6.6:
  SONAR-9986 Add back id to WS api/components/search_projects

SONAR-9986 Add back id to WS api/components/search_projects

Fix Quality flaws

SONAR-9263 log warning once when OAuth URL is http but not https

Remove unused dependency on commons-beanutils

Drop OldRestoreAction (api/profiles/restore)

SONAR-9982 Upgrade to Hazelcast 3.8.6

Fix warning at startup regarding JVmStateSection

Two same instances of JvmStateSection are defined in pico. It generates
the warning log:
"WARN  ce[][o.s.c.p.ComponentKeys] Bad component key: org.sonar.process.systeminfo.JvmStateSection@13078cb2. Please implement toString() method on class org.sonar.process.systeminfo.JvmStateSection"

Delete deprecated and unused Server#getDeployDir()

Fix package of class CopyDeprecatedServerId

SONAR-9980 allow to search for words >15 chars in rule descriptions

SONAR-9965 add test for html content in the rule description

SONAR-8516 Improve UI of quality gate section on the project dashboard

SONAR-9691 Align size badges on project cards

SONAR-9822 Quality Gate cannot be displayed directly if it includes a custom metric that was deleted

SONAR-9780 Add keyboard shortcuts help on the Rules page

SONAR-9756 update wording for branch life time

fix incorrect characther in core.properties

SONAR-8497 Increase size of input on Encryption page

SONAR-9790 Add project context to a file permalink

SONAR-9938 Hide histogram in creation date facet on issues page when there is no results

SONAR-9473 Differentiate between selected issues and hovered issues

SONAR-9579 No redirect when browsing my new issues without authentication

SONAR-9966 Page extensions are shown for branches

SONAR-9686 Secondary locations without messages should not be numbered

SONAR-9788 Onboarding tutorial is shown many times

warn about missing messages

SONAR-9830 Onboarding of C# projects is not working properly

SONAR-9968 distribute SonarTS on fresh installations

Upgrade logback and SLF4j

Logback 1.1.x suffers from https://nvd.nist.gov/vuln/detail/CVE-2017-5929,
which has been fixed in 1.2.0. This vulnerability can't be exploited
because the Logback socket server is not enabled. Nevertheless
upgrading is a best practice.

SONAR-9978 Upgrade Tomcat to 8.5.23

SONAR-7942 When there is no SCM data sonar.issues.defaultAssigneeLogin must be used

SONAR-9863 Drop web app licenses and server id code

SONAR-9863 replace old "permanent server ID" by the new one

SONAR-9863 drop internal WS api/server_id and api/licenses

SONAR-9979 Fix potential vulnerability in plugins built with API <= 5.2

Fix Quality flaws

SONAR-8392 Order components by name ascending as default ordering for equalities

SONAR-8770 Remove bundles ending by '.abbreviation'

SONAR-9963 WS api/metrics/update fails properly if domain is longer than 64 characters

SONAR-8331 Deprecate and hide complexity related metrics

SONAR-9922 Metric new_lines renamed from 'Lines of New Code' to 'New Lines'

SONAR-9823 WS api/issues/search returns the line hash

SONAR-7734 Clarify message when one of several parameters is required

Fix quality flaws

Automatic merge from branch-6.6

* origin/branch-6.6:
  SONAR-8798 fix error when sonar.log.maxFiles=0

SONAR-8798 fix error when sonar.log.maxFiles=0

Automatic merge from branch-6.6

* origin/branch-6.6:
  SONAR-9971 allow tests messages longer then 32766 characters
  SONAR-9965 allow rule descriptions longer then 32766 characters
  SONAR-9965 avoid obsolete subfields in Elasticsearch keyword fields

SONAR-9971 allow tests messages longer then 32766 characters

SONAR-9965 allow rule descriptions longer then 32766 characters

SONAR-9965 avoid obsolete subfields in Elasticsearch keyword fields

Each field with subfields used to have one obsolete additional subfield with the same name as the name itself. This one is now removed. Those obsolete subfields also sometimes caused issues with long text values (like rule descriptions or test messages).

SONAR-9928 Fix IT relying on WS to query database

SONAR-9928 WS api/components/search relies on Component ES index

SONAR-9928 Index and filter organization in component ES index

SONAR-9928 Search components in ES

SONAR-9928 ComponentIndexQuery renamed to SuggestionQuery

SONAR-9928 Index language in component ES index

SONAR-9799 deprecate legacy branch param (#2662)

SONAR-7574 Allow to set log level to WARN or ERROR in API

SONAR-8972 Limit the input length when creating custom metrics

SONAR-8499 Remove orange underline for administration menu

SONAR-9673 Add shadows to dropdown menus

SONAR-9785 Add new languages on the about page

SONAR-9867 Add button promoting governance on background tasks page

SONAR-9927 Project admins see "Cancel All" button on Background Tasks page

SONAR-9847 Add tooltip explaining how to get branch support

SONAR-8305 Fix descriptions of "Browse" and "Administer Issues" permissions

SONAR-9838 Append "Administration" to all titles of admin pages

serve l10n messages from dev server

SONAR-9815 Add focus to the close button of the project creation confirmation dialog

Revert "SONAR-9757 Copy issues in directories with unchanged files only"

This reverts commit aa5537ba9748dd4f3f9c876064ff6a6e641cba3e.

Skip storage on short branch if file status is SAME

Analyze all files even in short branches

SONAR-9920 Document permissions needed for api/qualitygates WS

SONAR-9920 Quality gate administrators can do all qg related actions

SONAR-9930 improve naming in DefaultTempFolderTest

SONAR-9930 Noisy ERROR logs when failing to delete a temp directory that does not exist

SONAR-9698 Left-arrow to issues list doesn't scroll to right place

SONAR-9555 Page is not scrolled to selected issue when using IE11

SONAR-7709 Help users to not enter wrong date periods

SONAR-9750 Impossible to bulk add a new tag on issues from the UI

SONAR-9696 UI asks to comment issues after bulk change

SONAR-9777 Open severity facet and close resolutions facet by default

SONAR-9876 Improve facet badges

ignore .vscode in .flowconfig

SONAR-9749 Order secondary locations markers by line

SONAR-9690 Improve positioning of secondary locations markers

Automatic merge from branch-6.6

* origin/branch-6.6:
  Prepare for next development iteration
  SONAR-9721 Fix potential OkHttpClient connection leak
  Publish 6.6 Release Candidate 1
  fix quality flaws
  Propagate parameters of SQ analysis required by burgr
  fix unwanted text wrapping in the header in ie11
  SONAR-9908 on Windows, launch Elasticsearch directly, without batch files (#2642)
  SONAR-9694 Ignore when secondary locations are out of current file for backdating
  Fix sidebar position helper in IE

Prepare for next development iteration

SONAR-9721 Fix potential OkHttpClient connection leak

Publish 6.6 Release Candidate 1