Fix documentation of JVM server mode

SONAR-5705 Restore internal mojo to have clean failure

SONAR-6022 Update dead links pointing to documentation

SONAR-5753 Update assertions isEqualTo("") -> isEmpty()

SONAR-5753 Save empty string instead of null for root projects

Remove wront comment about file.encoding=UTF-8 in sonar.properties

SONAR-5753 moduleUuidPath of foot projects should be empty instead of NULL

Improve ComponentTesting and SnapshotTesting

SONAR-5849 Improve the way to get modules tree by using components.moduleUuid

SONAR-5849 Performance issue of Project Referentials WS for project with many modules

SONAR-5849 Extract logic from ProjectReferentialsAction to ProjectReferentialsLoader

SONAR-5995 Remove log on memory leak generated by ProgressLogger when stopping the server

SONAR-5967 Remove the limitation of 3000 lines

SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit

SONAR-5817 Fix max number of lines to 500000

SONAR-5971 The component viewer, in differential mode, might display some unexpected issues

SSF-26 Cross-Site Scripting on Manual Metrics

SSF-25 SMTP configuration password

Revert "SSF-25 SMTP configuration password"

This reverts commit 181538a6d0884e74beec8ad6aa3dcf460baec5ea.

SSF-25 SMTP configuration password

Invalidate browser cache for issues app

Fix display of debt characteristic in the issue rule modal

SONAR-5878 Fix regression when parsing project properties

Fix navigation between issues in a big file

Deprecate SCM metrics for later removall

SONAR-5962 The size of the analysis reports queue is wrong

SONAR-5869 Restore built-in Java Colorizer support for test files

SONAR-5867 Sort symbol references to avoid variations between consecutive runs

Fix overlapping of issue message

Fix pointer cursor on analysis reports page

Fix problem with zero-sized component viewer

[maven-release-plugin] prepare for next development iteration

[maven-release-plugin] prepare release 5.0-RC3

Readd the assembly configuration since zip file has incorrect mode

SONAR-5929 TreeMap Widget: colors of squares are not matching Sqale Rating

Remove useless Elasticsearch Marvel settings

[maven-release-plugin] prepare for next development iteration

[maven-release-plugin] prepare release 5.0-RC2

Remove too early deprecations

Temporary disable web tests

Try to remove unstable test

Web Tests: take a screenshot on failure. Fix the test

Web Tests: take a screenshot on failure

SONAR-5753 Fix issue on MySQL

SONAR-5718 Do not allow to modify the search sorting

Db migration to remove sort criteria from existing issue filters

Remove unused ruby files (issues2 MVC)

[maven-release-plugin] prepare for next development iteration

[maven-release-plugin] prepare release 5.0-RC1

SONAR-5923 A project admin user cannot delete a project

Fix incorrect commit where URL of Codehaus was changed

SONAR-5718 Fix scrolling between issues

SONAR-5718 Fix sorting of facet items

SONAR-5877 Improve readability of issues on the same line

SONAR-5877 Improve consistency of scm tooltips

Fix component viewer test

Remove System.out introduced in JB's commit

Fix quality flaw

fix quality flaw

Fix quality flaws

Fix quality flaws

Fix some quality flaws

SONAR-5915 Escape project key when loading project referentials

Remove unused LOGGER in DefaultModuleFileSystem

Fix quality flaws

Fix quality flaw

Fix quality flaws

Automatic merge from branch-4.5

* origin/branch-4.5:
  SSF-24 SQL Injection on Measures page
  Revert "SONAR-5844 Profile inheritance is always displaying '0 rules' whatever the content of Profiles"
  SONAR-5844 Profile inheritance is always displaying '0 rules' whatever the content of Profiles
  SONAR-5902 Fix preserving of planned=false
  Update documentation of PostJob extension

SSF-24 SQL Injection on Measures page

Revert "SONAR-5844 Profile inheritance is always displaying '0 rules' whatever the content of Profiles"

This reverts commit a060b930acec945a80cbecbba92db66e5f859a91.

SONAR-5844 Profile inheritance is always displaying '0 rules' whatever the content of Profiles

Fix quality flaws

Fix quality flaws

Fix server-test-benchmarks assertions because of Lucene optimizations

Support missing dates in the migration FeedLissueLongDates

Re-enable IssueIndexMediumTest

Fix quality flaw

Refactor FileCache#newTempFile()

Improve stability of sonar-server-benchmarks

Optimize Lucene FS so it does not evolve when estimating size

SONAR-5902 Fix preserving of planned=false

SONAR-5877 Update component viewer coverage popup

Fix assertions of sonar-server-benchmarks

Remove test in SearchServerTest because of too many false-positives on slow windows environment

Fix quality flaws

Fix assertions of sonar-server-benchmarks

Fix some quality flaws

Fix some quality flaws

SONAR-5642 Remove Git command line implementation

Update documentation of PostJob extension

SONAR-5718 Fix activation of action plans facet

Fix quality flaw

SONAR-5801 Protect against null file_sources.data column

Add assertions to sonar-server-benchmarks

Add assertions for SonarSource performancing box to sonar-server-benchmarks

New settings for sonar-server-benchmarks

Rename module sonar-data-test to sonar-server-benchmarks

Fix merge

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-4.5'

Conflicts:
sonar-plugin-api/src/main/java/org/sonar/api/web/CodeColorizerFormat.java

Revert name of FILE_SOURCES index

Remove some usages of IssueNormalizer in IssueIndex