Fix quality flaws

SONAR-5959 Change behavior of component-related issue search queries

SONAR-5954 Fix descriptions of component(Key|Uuid)s and moduleUuids

SONAR-5959 Add onComponentOnly parameter to IssueQuery

SONAR-5820 Ability to "Show only" or "Hide" template rules

SONAR-5820 When there is no rules matching the search criteria, a "No Coding Rules" message should be displayed

SONAR-5922 Make the difference between default rule severity and activation severity more obvious

SONAR-5607 Make it possible to sort unit tests by status

Adjust timeout of IssueIndexBenchmarkTest

SONAR-5820 Ability to filter rules that are inactive in a quality profile

fix quality flaws

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-5.0'

SONAR-5753 moduleUuidPath of foot projects should be empty instead of NULL

SONAR-5820 Fix display of rule permalink

fix - close connection in unit test

SONAR-5910 SONAR-5911 decompress report and deactivate issues persistence on server side

Revert "Revert "SONAR-5911 persist issues on server side""

This reverts commit e6bf968753bf2ec666aff3d802fa23c40ead8832.

SONAR-5820 Ability to create, edit and delete a "Manual" rule

Fix some quality flaws

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  Improve ComponentTesting and SnapshotTesting

Improve ComponentTesting and SnapshotTesting

SSF-10 Prevent Clickjacking

SONAR-5997 Upgrade Tomcat from 7.0.54 to 7.0.57

Improve stability of randomly allocated ports (when sonar.web.port or sonar.search.port are set to zero)

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5849 Improve the way to get modules tree by using components.moduleUuid

SONAR-5849 Improve the way to get modules tree by using components.moduleUuid

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5849 Performance issue of Project Referentials WS for project with many modules
  SONAR-5849 Extract logic from ProjectReferentialsAction to ProjectReferentialsLoader

SONAR-5849 Performance issue of Project Referentials WS for project with many modules

SONAR-5849 Extract logic from ProjectReferentialsAction to ProjectReferentialsLoader

Revert "SONAR-5911 persist issues on server side"

This reverts commit 0315dec02e79f8fc3f59d4e7d83710b02dc6735b.

Fix quality flaws

SONAR-5820 Fix display of quality profiles

SONAR-5820 Add tooltips

Fix quality flaws

SONAR-5820 Hide details when refine search

Improve modal view ui

Add modal form view

Fix select of facet values

SONAR-5820 On "template" rules, make it possible to create "custom" rules

SONAR-5820 Display the list of custom rules created from a template rule

Fix quality flaws

SONAR-5820 Provide a permalink on each rule description

SONAR-5820 Add query filter

Fix quality flaws

SONAR-5820 Add activation severity filter

SONAR-5820 Add inheritance filter

Add less, coffee, hbs files to analysis

SONAR-5911 persist issues on server side

SONAR-5911 refactoring digest report steps

purge – specify contract method

SONAR-5820 Show "DEPRECATED" label in the list

SONAR-5820 Add "available since" filter

SONAR-5820 Sort by name by default

SONAR-5820 Fix scrolling issues

SONAR-5820 Fix profile activation

SONAR-5820 Complete rule details with sqale metadata

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5995 Remove log on memory leak generated by ProgressLogger when stopping the server

SONAR-5995 Remove log on memory leak generated by ProgressLogger when stopping the server

Revert "SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit"

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5967 Remove the limitation of 3000 lines
  SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit
  SONAR-5817 Fix max number of lines to 500000
  SONAR-5971 The component viewer, in differential mode, might display some unexpected issues

SONAR-5967 Remove the limitation of 3000 lines

SONAR-5820 Update MTs

SONAR-5820 Add quality profiles

SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit

SONAR-5817 Fix max number of lines to 500000

SONAR-5971 The component viewer, in differential mode, might display some unexpected issues

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SSF-26 Cross-Site Scripting on Manual Metrics

SSF-26 Cross-Site Scripting on Manual Metrics

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-5.0'

Conflicts:
server/sonar-web/src/main/js/tests/e2e/views/issues.jade

SSF-25 SMTP configuration password

Revert "SSF-25 SMTP configuration password"

This reverts commit 181538a6d0884e74beec8ad6aa3dcf460baec5ea.

SONAR-5820 Improve the rule description formatting

SSF-25 SMTP configuration password

use byte[] instead of a stream when inserting a report in database

Invalidate browser cache for issues app

Fix display of debt characteristic in the issue rule modal

SONAR-5820 Create a new coding rules page

Fix issue when publishing components on Views

SONAR-5972 A plugin can't declare a quality profile related to a language which is not installed

Fix ordering in issue filter migration test

SONAR-5970 Have tag changes appear in email notification

SONAR-5958 Rename parameters used in issue filters

SONAR-5935 Consider "set_tags" as one of the default actions (not shown in "More")

Fix some quality flaws

SONAR-5945 Improve export of components in report and fix upload

SONAR-5910 fix get decompressed report

SONAR-5956 Use new parameter for "modules" criterion/facet

SONAR-5830 Fix wrong html id

Fix quality flaws

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5878 Fix regression when parsing project properties
  Fix navigation between issues in a big file

SONAR-5878 Fix regression when parsing project properties

Fix quality flaws

SONAR-5830 Possibility to map authors (from SCM) to SonarQube users

Fix navigation between issues in a big file

Adjust size of ES dir in benchmark

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  Deprecate SCM metrics for later removall
  SONAR-5962 The size of the analysis reports queue is wrong

Fix compatibility of ES 1.4 with KOPF

Use the same input size for sourceline ES and DB benchmarks

Minor optimization in SourceLineResultSetIterator

Fix thread cleanup on errors in BulkIndexer