SONAR-5868 Improve performances of fs indexation

SONAR-5868 Add WS to fetch line hashes for issue tracking

SONAR-5845 Fix overlap of issue message and issue line number

Update qualifier icons

SONAR-5845 Fix separator between issues

SONAR-5718 Small UI fix

SONAR-5718 Fix double page loading

Consistent view of source scm

SONAR-5868 Try to reduce memory consumption of line hashes

SONAR-5718 Fix grouping issues by component

SONAR-5718 Show SCM around the code

SONAR-5718 Group issues by component

Fix some quality flaws

SONAR-5801 Always use last column of the CSV structure as the source line

SONAR-5826 Fix column type to please Oracle

Add BaseDoc#getFieldAsDate() and getNullableFieldAsDate()

Fix SQL request used by issues indexing

* strict comparison of issue updated_at

SONAR-5743 Fix issue with dates in source line index

Cleanup (remove sysouts)

SONAR-5872 Add module key on issues in api/issues/search

SONAR-5872 Add module key in api/issues/show

SONAR-5866 Add coverage data into file_sources table + migration

Remove deprecation on CoverageMeasureBuilder

Change the monospace font

Automatic merge from branch-4.5

* origin/branch-4.5:
  SONAR-5874 Support deprecated org.sonar.api.rules.RuleRepository when extending rules of org.sonar.api.server.rule.RulesDefinition

SONAR-5874 Support deprecated org.sonar.api.rules.RuleRepository when extending rules of org.sonar.api.server.rule.RulesDefinition

SONAR-5868 Fix migration test

Replace java.util.Uuid by org.sonar.api.utils.Uuids in tests

SONAR-5868 Allow issue tracking mechanism to work without full previous sources

SONAR-5826 Use (big) integer column instead of DB timestamp for file_sources

SONAR-5743 Move new source WS to api/sources/lines

Fix coding rules modals

SONAR-5845 Fix rule description

SONAR-5718 Fix memory leak

Fix action plan widget

SONAR-5718 Fix clipping effect

Fix drilldown by open/reoped issues

SONAR-5718 Handle big files

Revert "SONAR-5718 Add debt icon"

This reverts commit ef11f4953b5319435f408063b5e368433c158499.

SONAR-5845 Apply feedback

Fix IssueResultSetIteratorTest on non-H2 dbs (new try)

sonar-data-test: fix java xmx

Fix sorting of issues - handle virtual line "zero"

SONAR-5743 New Source Code + SCM WS

SONAR-5801 fix SourceLineResultSetIterator on postgresql

Fix some quality flaws

Fix some quality flaws

 Fix IssueResultSetIteratorTest on postgresql

SONAR-5801 test can not commit an auto-commit connection on non-H2 dbs

SONAR-5801 fix sonar-data-test

SONAR-5801 improve test of SourceLineResultSetIteratorTest

sonar-data-test: use bulk inserts

SONAR-5801 fix compatibility with all dbs

Fix test on Windows

Try to fix handling of BOM on Windows

SONAR-5827 Use byte[] instead of String to manipulate file_sources data so that all DBs are happy

SONAR-5827 Fix NPE for languages with no source colorizer

SONAR-5827 Execute CodeColorizer on batch side to feed highlighting

SONAR-5801 Fix test on MSSQL and Postgres

SONAR-5767 Not able to display Integration Tests Coverage when line given by Coverage Report can't be found in Source File

SONAR-5718 Fix comment shortcut

SONAR-5544 Make the Complexity widget comply with the new SonarQube widget Look and Feel

SONAR-5777 Component Viewer fails to bulk change a big amount of issues

 Remove useless comment in ResultSetIterator

 Fix compatibility of SourceLineDoc with Java 6

 Add test to ResultSetIteratorTest

 Revert last change of ResultSetIterator

 * ResultSet#isLast() can have performance issues, or not be implemented at all, on some JDBC drivers
 * ResultSet#isLast() returns true on H2 if empty results

 Fix quality flaws

SONAR-5801 Delete unneeded lines after indexation of source

SONAR-5801 Index source lines at startup and after analysis

SONAR-5801 Create search index structure and initial indexation method for source lines

Remove some unused imports

Centralize algorithm of UUID generation

Fix some quality flaws

SONAR-5827 Enable bulk insert

Automatic merge from branch-4.5

* origin/branch-4.5:
  Fix javadoc
  Fix cancelling of editing of rule tags
  Fix flash vulneribility

Refactor indexing of issueAuthorization

Fix javadoc

SONAR-5827 Select all previous file lines data hash with a single SQL query

Add duration of filesystem indexation in profiling

create experimental web service to digest analysis report

clean analysis_report web services documentation and declare internal use

SONAR-5845 Add a rule overlay

SONAR-5827 Fix corner cases with highligthing offset conversion

Fix cancelling of editing of rule tags

Fix flash vulneribility

Fix duplication markers

SONAR-5845 Feedback applied

SONAR-5827 Fix issue on Oracle (null vs empty string)

SONAR-5827 Feed the new "file_sources" table

 SONAR-5778 Embed Java Plugin 2.6

Automatic merge from branch-4.5

* origin/branch-4.5:
  SONAR-5860 Disable SSLv3 in Tomcat connector

 SONAR-5860 Disable SSLv3 in Tomcat connector

SONAR-5818 add todo for futur use of ProjectSettings class

SONAR-5826 Revert to (get|set)Bytes to please Oracle, refactor migration test to please H2

SONAR-5628 add medium test

SONAR-5718 Improve readability of issues list

Synchronize database and ES with a journal approach

Refactor the way to declare ES indices.

- BaseIndex has too many responsibilities
- SearchClient must not override TransportClient, else it can't be easily used in tests

Fix quality flaws