SONAR-5820 Sort by name by default

SONAR-5820 Fix scrolling issues

SONAR-5820 Fix profile activation

SONAR-5820 Complete rule details with sqale metadata

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5995 Remove log on memory leak generated by ProgressLogger when stopping the server

SONAR-5995 Remove log on memory leak generated by ProgressLogger when stopping the server

Revert "SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit"

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5967 Remove the limitation of 3000 lines
  SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit
  SONAR-5817 Fix max number of lines to 500000
  SONAR-5971 The component viewer, in differential mode, might display some unexpected issues

SONAR-5967 Remove the limitation of 3000 lines

SONAR-5820 Update MTs

SONAR-5820 Add quality profiles

SONAR-5967 Instead of not displaying anymore the source files containing more than 3'000 lines, only the highlighting mechanism should be deactivated above this limit

SONAR-5817 Fix max number of lines to 500000

SONAR-5971 The component viewer, in differential mode, might display some unexpected issues

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SSF-26 Cross-Site Scripting on Manual Metrics

SSF-26 Cross-Site Scripting on Manual Metrics

Merge remote-tracking branch 'origin/branch-5.0'

Conflicts:
server/sonar-web/src/main/js/tests/e2e/views/issues.jade

SSF-25 SMTP configuration password

Revert "SSF-25 SMTP configuration password"

This reverts commit 181538a6d0884e74beec8ad6aa3dcf460baec5ea.

SONAR-5820 Improve the rule description formatting

SSF-25 SMTP configuration password

use byte[] instead of a stream when inserting a report in database

Invalidate browser cache for issues app

Fix display of debt characteristic in the issue rule modal

SONAR-5820 Create a new coding rules page

Fix issue when publishing components on Views

SONAR-5972 A plugin can't declare a quality profile related to a language which is not installed

Fix ordering in issue filter migration test

SONAR-5970 Have tag changes appear in email notification

SONAR-5958 Rename parameters used in issue filters

SONAR-5935 Consider "set_tags" as one of the default actions (not shown in "More")

Fix some quality flaws

SONAR-5945 Improve export of components in report and fix upload

SONAR-5910 fix get decompressed report

SONAR-5956 Use new parameter for "modules" criterion/facet

SONAR-5830 Fix wrong html id

Fix quality flaws

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5878 Fix regression when parsing project properties
  Fix navigation between issues in a big file

SONAR-5878 Fix regression when parsing project properties

Fix quality flaws

SONAR-5830 Possibility to map authors (from SCM) to SonarQube users

Fix navigation between issues in a big file

Adjust size of ES dir in benchmark

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  Deprecate SCM metrics for later removall
  SONAR-5962 The size of the analysis reports queue is wrong

Fix compatibility of ES 1.4 with KOPF

Use the same input size for sourceline ES and DB benchmarks

Minor optimization in SourceLineResultSetIterator

Fix thread cleanup on errors in BulkIndexer

Rename resources.json -> components.json

SONAR-5934 Change validation order

SONAR-5963 Automatically reactivate user when using a disabled login

SONAR-5955 Extract utility method to convert component keys to UUIDs

SONAR-5954 Deprecate and update description of issue search WS parameters

SONAR-5934 Rewrite create users WS, SONAR-5961 Rewrite the update user WS

Deprecate SCM metrics for later removall

SONAR-5962 The size of the analysis reports queue is wrong

SONAR-5607 Apply feedback

SONAR-5884 Apply feedback

SONAR-5903 Fix lost of rule tags and NPE

SONAR-5945 Rename resource -> component in batch protocol

SONAR-5934 User Creation WS in Java

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  SONAR-5869 Restore built-in Java Colorizer support for test files
  SONAR-5867 Sort symbol references to avoid variations between consecutive runs
  Fix overlapping of issue message
  Fix pointer cursor on analysis reports page
  Fix problem with zero-sized component viewer

SONAR-5869 Restore built-in Java Colorizer support for test files

SONAR-5750 Bump size of top-tags facet to 10

SONAR-5867 Sort symbol references to avoid variations between consecutive runs

SONAR-5952 Update the issue permalink in the notification email

Set xml-apis as provided artifact (part of Java 7)

SONAR-5897 Bump migration execution order

SONAR-5897 Fix handling of empty strings (instead of nulls) in rules.tags column

SONAR-5884 Update links in the coverage and duplications popups

Invalidate browser cache during web tests

Fix the issue permalink

Go to issue detail by mouse double click and return key

Fix pointer cursor on analysis reports page

Fix quality flaws

SONAR-5945 Fix NPE when having issues on deleted resources

SONAR-5951 declare jdbcType on tables FILE_SOURCES, RULES and SNAPSHOT_DATA too

SONAR-5824 upgrade to elasticsearch 1.4.2

Fix some quality flaws

SONAR-5945 Upload issues in analysis report

Add benchmark of scrolling of db table FILE_SOURCES

Upgrade to mockito 1.10.17 as 1.10.10 is not available in central repo

SONAR-5910 fix methods contracts and possible NPE

SONAR-5935 Better handling of keyboard for tags

Fix overlapping of issue message

Fix pointer cursor on analysis reports page

Adjust assertions of ES perf tests because of upgrade to Elasticsearch 1.4.1

Fix problem with zero-sized component viewer

SONAR-5934 Fix query on Oracle

Automatic merge from branch-5.0

* origin/branch-5.0:
  [maven-release-plugin] prepare for next development iteration
  [maven-release-plugin] prepare release 5.0-RC3

SONAR-5934 Use old rails user WS for the moment

Fix JDBC cursor contention

Merge branch 'skitt-master'

Merge branch 'master' of https://github.com/skitt/sonarqube into skitt-master

Prepare removal of BaseIndex from IssueIndex

Allow to declare doc_values fields in Elasticsearch

SONAR-5824 upgrade to elasticsearch 1.4.1

Specify data types on inserts into project_measures

At least when using Oracle databases, projects with large volumes of
updates (over a million inserts per hour) see lots of cursor
contention, accounting for up to 40% of the database's activity (after
adjusting the shared pool size appropriately). This is due to the
presence of null values where the database can't determine the data
type, and therefore has to try different variants of the statement.

Specifying the data types on the non-blob columns avoids the type
uncertainty, and solves the cursor contention.

Signed-off-by: Stephen Kitt <steve@sk2.org>

SONAR-5934 Simple User Creation WS

Fix enforcer rule for java 7