Let org.eclipse.jgit.pgm use BooleanTriState

Change-Id: I575cd5e1ecd326514a8bb4c36a86a2dc71ba5457

Merge branch 'stable-6.0'

* stable-6.0:
  [bazel] Skip ConfigTest#testCommitTemplatePathInHomeDirecory
  [errorprone] Fix InfiniteRecursion error in RecordingLogger
  [errorprone] Suppress Finally error in ObjectDownloadListener
  [errorprone] Fix implicit use of default charset in FileBasedConfigTest
  [errorprone] Suppress FutureReturnValueIgnored in FileRepository#autoGc

Change-Id: I08d58c8f3f04e3a920da43b5fb252b1654c2b33c

Merge changes I6a22f37f,I092389e4,I20af1d8d,I83332efc into stable-6.0

* changes:
  [bazel] Skip ConfigTest#testCommitTemplatePathInHomeDirecory
  [errorprone] Fix InfiniteRecursion error in RecordingLogger
  [errorprone] Suppress Finally error in ObjectDownloadListener
  [errorprone] Fix implicit use of default charset in FileBasedConfigTest

Merge "[errorprone] Suppress FutureReturnValueIgnored in FileRepository#autoGc" into stable-6.0

Merge branch 'stable-6.0'

* stable-6.0:
  UploadPack v2 protocol: Stop negotiation for orphan refs
  Complete update to servlet api 4.0.0

Change-Id: I55ab6e8fd4a76e4313e37b12f9fc5d5e4b84a681

Merge branch 'stable-5.13' into stable-6.0

* stable-5.13:
  UploadPack v2 protocol: Stop negotiation for orphan refs

Change-Id: I6a9ed8338ffbf5363e48d640a2c4209e4e503549

Merge branch 'stable-5.12' into stable-5.13

* stable-5.12:
  UploadPack v2 protocol: Stop negotiation for orphan refs

Change-Id: Ib43068c32d9cb8effe4b873396391dc3c9197a6e

Merge branch 'stable-5.11' into stable-5.12

* stable-5.11:
  UploadPack v2 protocol: Stop negotiation for orphan refs

Change-Id: I5db432bd416cfa8d3dd295bdce63e31d5f160a8a

[bazel] Skip ConfigTest#testCommitTemplatePathInHomeDirecory

Move this test to another class and skip it when running tests with
bazel since the bazel test runner does not allow to create files in the
home directory.

FS#userHome retrieves the home directory on the first call and caches it
for subsequent calls to avoid overhead in case path translation is
required (currently on cygwin). This prevents that the test can mock the
home directory using MockSystemReader like SshTestHarness does.

Change-Id: I6a22f37f4a19eb4b4935509eae508a23e56db7aa

[errorprone] Fix InfiniteRecursion error in RecordingLogger

Change-Id: I092389e428232a4fe7613d846c288d285ae9102c

[errorprone] Suppress Finally error in ObjectDownloadListener

Change-Id: I20af1d8d931608e93fbc52e127f1b7bafd2f917c

[errorprone] Fix implicit use of default charset in FileBasedConfigTest

Change-Id: I83332efc498a5bce242915a1eec2346e6e1f58fd

[errorprone] Suppress FutureReturnValueIgnored in FileRepository#autoGc

Ignore the FutureReturnValueIgnored warning for the unused return value
of #gc.

Change-Id: I4e7a2f85d404962c01726f9a1d079fe4a6430a1b

UploadPack v2 protocol: Stop negotiation for orphan refs

The fetch of a single orphan ref (for example Gerrit meta ref:
refs/changes/21/21/meta) did not stop the negotiation so client
had to advertise all refs. This impacts the fetch performance
on repositories with a large number of refs (for example on
Gerrit repository it takes 20 seconds to fetch meta ref
comparing to 1.2 second to fetch ref with parent).

To avoid this issue UploadPack, used on the server side,
now checks if all `want` refs have parents, if not this
means that client doesn't need any extra objects, hence
the server responds with `ready` and finishes the
negotiation phase.

Bug: 577937
Change-Id: Ia3001b400b415d5cf6aae45e72345ca08d3af058

Complete update to servlet api 4.0.0

Ibd0240cf7ad updated servlet-api to 4.0.0 only partially for the
osgi-based build in Eclipse.

Complete this by updating dependencies also in maven and bazel build.

Change-Id: Ic4c3eb78c538007ca2177f6109d415147e58eabe

Switch to Apache MINA sshd 2.8.0

Update version in root pom.xml, adapt code & manifests. Bump the
dependency in the bazel build.

Update Orbit to I20220105095044 to get Apache MINA sshd 2.8.0 and
regenerate all target platforms.

Bug: 577542
Change-Id: Iefc02ceda8a9b0683f49aa8059999a5486d1f322
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge changes Ia744cd4a,Id95350c7,I746b7fb7

* changes:
  sshd: backport upstream fix for SSHD-1231
  [releng] bump japicmp base version and configure sshd bundles
  Merge branch 'stable-6.0'

sshd: backport upstream fix for SSHD-1231

SSHD-1231[1] may lead to exceptions when trying to authenticate first
with an RSA key that is rejected by the server. The upstream fix is a
one-liner but unfortunately didn't make it into Apache MINA sshd 2.8.0.

Incorporate the upstream fix in JGitPublicKeyAuthentication, and add
a test case for this.

[1] https://issues.apache.org/jira/browse/SSHD-1231

Bug: 577545
Change-Id: Ia744cd4aa569bccd937c855f3bb45c0116915bad
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Add myself to .mailmap

Signed-off-by: Sebastian Schuberth <sebastian.schuberth@bosch.io>
Change-Id: I46e7bccb6c0c1e4dc21450220279b0546723773e

[releng] bump japicmp base version and configure sshd bundles

Bump the japicmp base version to 6.0.0.202111291000-r and configure
the o.e.j.ssh.apache and o.e.j.ssh.apache.agent bundles to ignore
internal classes.

Change-Id: Id95350c73b9141e1583f9de5fb6ab2496c7407d9
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-6.0'

* stable-6.0:
  Use slf4j-simple instead of log4j for logging
  Update orbit to R20211213173813

Change-Id: I746b7fb71571020ce49f7b50fd675c9864327719
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.13' into stable-6.0

* stable-5.13:
  Use slf4j-simple instead of log4j for logging
  Update orbit to R20211213173813

Change-Id: I219ef3901c1d908b91bf9c8f00431b22686ff7a5
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Use slf4j-simple instead of log4j for logging

JGit uses slf4j-api as logging API.

The libraries
- org.eclipse.jgit.http.test
- org.eclipse.jgit.pgm
- org.eclipse.jgit.ssh.apache.test
- org.eclipse.jgit.test
used the outdated log4j 1.2.15 which is EOL since years.

Since both jgit command line and also the tests don't need sophisticated
logging features replace log4j with the much simpler slf4j-simple log
implementation. The org.slf4j.binding.simple 1.7.30 archive has only
25kB instead of 429kB for log4j 1.2.15

Applications using jgit are free to choose any other log implementation
supporting slf4j API.

Change-Id: I89e85cd3c76e954c3434622510975ce65dc227d4

Update orbit to R20211213173813

and update
- com.google.gson to 2.8.8.v20211029-0838
- javaewah to 1.1.13.v20211029-0839
- net.i2p.crypto.eddsa to 0.3.0.v20210923-1401
- org.apache.ant to 1.10.12.v20211102-1452
- org.apache.commons.compress to 1.21.0.v20211103-2100
- org.bouncycastle.bcprov to 1.69.0.v20210923-1401
- org.junit to 4.13.2.v20211018-1956

Change-Id: I3ac39fc8a5df571d2e290241a03668f1e60880b4

Merge branch 'stable-6.0'

* stable-6.0:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: Icc38ce20c1c791c8cf0ca3dcab46b1151f122805

Merge branch 'stable-5.13' into stable-6.0

* stable-5.13:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: Iaff40b144aea9ad5e6d0fa6b448ad7d527992832

Merge branch 'stable-5.12' into stable-5.13

* stable-5.12:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: I6a0266cbcaaf18d0d60f0abecb5434fd919c44b7

Merge branch 'stable-5.11' into stable-5.12

* stable-5.11:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: I4e241860c2ca50750e22c2761c515c9895688c55

Merge branch 'stable-5.10' into stable-5.11

* stable-5.10:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: Ie3f2d05aeb1aa04af707cfafef5780349be4d981

Merge branch 'stable-5.9' into stable-5.10

* stable-5.9:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: I4f954c48ad6e8ff18826fdc72d225bff3e3ae2d9

Merge branch 'stable-5.8' into stable-5.9

* stable-5.8:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: Ic97d38fc85daa00297abbfa186f83b779966e7ef

Merge branch 'stable-5.7' into stable-5.8

* stable-5.7:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: If9cc2f2bae5dbead7a38218828da461540be942e

Merge branch 'stable-5.6' into stable-5.7

* stable-5.6:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: I274d46d73cc896dcfde6e24c69c71f33aaa78d20

Merge branch 'stable-5.5' into stable-5.6

* stable-5.5:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: If904289feecd1e0d8466c1fb998f160f14d54b61

Merge branch 'stable-5.4' into stable-5.5

* stable-5.4:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: I84e11bdaa9306e23212dac9d8670557a18d40107

Merge branch 'stable-5.3' into stable-5.4

* stable-5.3:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: I3d8eb2fa721e1a791db47a2342acc690ced01715

Merge branch 'stable-5.2' into stable-5.3

* stable-5.2:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: Ib79c310c5b632e845ba69ce65e739ae0146103ca

Merge branch 'stable-5.1' into stable-5.2

* stable-5.1:
  Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

Change-Id: I17ede8876a0cf231c38cb9652c7bf51553b1e90e

Use FileSnapshot without using configs for FileBasedConfig

FileBasedConfig should not rely on auto-detection of
the file-snapshot attribute computation based on config.

The check was already performed when a new FileBasedConfig
is created at L158:

// don't use config in this snapshot to avoid endless recursion
newSnapshot = FileSnapshot.saveNoConfig(getFile());

The check was missing though when the FileBasedConfig is saved
to disk and the new snapshot is obtained from the associated
LockFile.

This change fixes the issue by keeping a non-config based
FileSnapshot also after a FileBasedConfig is saved.

Bug: 577983
Change-Id: Id1e410ba687e683ff2b2643af31e1110b103b356

Merge branch 'stable-6.0'

* stable-6.0:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"
  TreeRevFilter: fix wrong stop when the given path disappears

Change-Id: Id7540d03991cdcf6f405e946b8cbbcc6a9696a31
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.13' into stable-6.0

* stable-5.13:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"
  TreeRevFilter: fix wrong stop when the given path disappears

Change-Id: Ibd69e9d941ad9262b61dd0c4368e48cb82597a12
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.12' into stable-5.13

* stable-5.12:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: I6576872cc0f5dd452252fa6e4526086cdee65c28
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.11' into stable-5.12

* stable-5.11:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: Ib80336a42e22da729b9db1e573772504cc0a3e77
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.10' into stable-5.11

* stable-5.10:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: I9e79ea2a0c554a184e4ce3b13e375eac8b7a4ac5
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.9' into stable-5.10

* stable-5.9:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: I2a84c838a886d1d6383c34f50b418baa743c57b0
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.8' into stable-5.9

* stable-5.8:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: I88a629e571fec5a9820114ebf5765b5d94a276bd
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.7' into stable-5.8

* stable-5.7:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: Ied786ab5e3c0dd05f701705fce2d4ad85502c4d6
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.6' into stable-5.7

* stable-5.6:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: I454622dae6eb95aedbd858e3b12da72282d36673
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.5' into stable-5.6

* stable-5.5:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: I2622f1d384a88a556ba9d88f0d08a37af69e530c
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.4' into stable-5.5

* stable-5.4:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: Ia1665dd92ccc3811a6116f41421a05aca10fc6eb
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.3' into stable-5.4

* stable-5.3:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: I52a57a17abe60e30e3d7615f8cb4d0c5e6aebd9b
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.2' into stable-5.3

* stable-5.2:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: Id37f47a5ef2e3c8329eca30c171941f7e5606a85
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Merge branch 'stable-5.1' into stable-5.2

* stable-5.1:
  Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

Change-Id: I625667c2718ab31ae7df907c3dd6024a933913b8
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Revert "RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation"

This reverts commit f829f5f838e0f9c17373ea6cb3407976a8f395ff.

Using MISSING_FILEKEY as indicator for a non-existing file doesn't work
on Windows.

Bug: 577954
Change-Id: I92102a3d259f6cc0f367096a3213cfa794466817
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

TreeRevFilter: fix wrong stop when the given path disappears

When chgs[i] == adds[i], it indicated that a commit added some files
that pList[i] did not have, but didn't mean pList[i] is "empty tree
root".

Follow the example below:

.                           .
└── src                     └── src
    └── d1          ==>          └── d1
        └─ file1                    ├─  file1
                                    └── file2
   c.parents[i]                   c

The variable chg[i] equals to variable add[i],
but commit c.parents[i] is not "empty tree root".

We should add an additional check for no paths matching the filter.

Bug: 577227
Change-Id: I834e9ddd0de86b108b280a1139519ea962913b38
Signed-off-by: kylezhao <kylezhao@tencent.com>

Merge "PackBitmapIndexV1: support parallel loading of reverse index"

Add config reader for user-defined difftools

see: http://git-scm.com/docs/git-difftool

* add config reader for user-defined difftools
  * diff.tool
  * diff.guitool
  * difftool.prompt
  * difftool.trustExitCode
  * difftool.<tool>.path
  * difftool.<tool>.cmd
* add pre-defined difftools
* implemented "git difftool --tool-help" to verify config reader and
pre-defined difftools

Bug: 356832
Change-Id: Idde8fddbef61f3378ee565c6321570b3962d0e1d
Signed-off-by: Andre Bossert <andre.bossert@siemens.com>
Signed-off-by: Simeon Andreev <simeon.danailov.andreev@gmail.com>

PackBitmapIndexV1: support parallel loading of reverse index

Speed up bitmap creation by loading reverse index in parallel
to reading bitmap from storage. Latency changes from
(time_to_read_bitmap + time_to_load_reverse_index) to
max(time_to_read_bitmap, time_to_load_reverse_index).

Add new option to DfsReaderOptions to control parallel reverse index
loading. Static cached thread pool is added to PackBitmapIndexV1 for
reverse index loading, and when not in use consumes minimal resources.

Signed-off-by: Alina Djamankulova <adjama@google.com>
Change-Id: Ia37a1d739631d053e8bddb925ac8b0b81d22379e

Merge branch 'stable-6.0'

* stable-6.0:
  Add missing @since tags
  Add missing @since tag
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I694c011f322f9a19479ef67b9fc725371da7418f

Merge branch 'stable-5.13' into stable-6.0

* stable-5.13:
  Add missing @since tags
  Add missing @since tag
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: Icea0a4dced9688392e7f2411b98df52aed2b9c8c

Merge branch 'stable-5.12' into stable-5.13

* stable-5.12:
  Add missing @since tags
  Add missing @since tag
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I9c85b3a774480c4f4b56ecdf5015916349a0ddc0

Merge branch 'stable-5.11' into stable-5.12

* stable-5.11:
  Add missing @since tags
  Add missing @since tag
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I72f39fbe82dd578d71aa2e3ceccebb39a25c4e00

Merge branch 'stable-5.10' into stable-5.11

* stable-5.10:
  Add missing @since tags
  Add missing @since tag
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I84c73e11381c31566a12033db94e9afdcef5b705

Merge branch 'stable-5.9' into stable-5.10

* stable-5.9:
  Add missing @since tags
  Add missing @since tag
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I971745b529ff903ea8bf9c3dbbc746fa09f41041

Merge branch 'stable-5.8' into stable-5.9

* stable-5.8:
  Add missing @since tags
  Add missing @since tag
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I5e7c204c0e4c428df6f3b27ba1fc06326983f27c

Merge branch 'stable-5.7' into stable-5.8

* stable-5.7:
  Add missing @since tags
  Add missing @since tag
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot
creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: Ibe46e8479b57a54591ad7bd3cc29bf4a5274e43d

Add missing @since tags

Change-Id: Iaeca1d6154c1383ebe27b723e8814e262328eb48

Merge branch 'stable-5.6' into stable-5.7

* stable-5.6:
  Add missing @since tag
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I53e6cb4b3a34b32d964e486c1ff3d130eed6e406

Add missing @since tag

Change-Id: I665c860696b6981dfec87a60c4eb95060a02436f

Merge branch 'stable-5.5' into stable-5.6

* stable-5.5:
  Add missing @since tags
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I007e92c12fde8d765b75f103e9d530aa0834b7d7

Add missing @since tags

Change-Id: Id21e626201363dd3d0358bd709765e7fd07a0cbf

Merge branch 'stable-5.4' into stable-5.5

* stable-5.4:
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I5ce55c6c152a59602fef9fb08c16dedf666444e2

Merge branch 'stable-5.3' into stable-5.4

* stable-5.3:
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: I0e80612c8ddb934466105312f9107e91d581de0b

Merge branch 'stable-5.2' into stable-5.3

* stable-5.2:
  Remove unused import in ApacheSshTest
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: Id989365446cb55b9188e02e6e1f8cbc8ab71071c

Remove unused import in ApacheSshTest

Change-Id: I55ebddf232369389e717bbf8707f6e785de14bce

Merge branch 'stable-5.1' into stable-5.2

* stable-5.1:
  Update maven plugins
  Ignore missing javadoc in test bundles
  storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()
  RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation
  FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache
  Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2
  Fix p2 repository URLs

Change-Id: If3ad2cfb6c341b0ff5c2120a5a1646f6368d86e7

Update maven plugins

- build-helper-maven-plugin to 3.2.0
- jacoco-maven-plugin to 0.8.7
- maven-antrun-plugin to 3.0.0
- maven-dependency-plugin to 3.2.0
- maven-enforcer-plugin to 3.0.0
- maven-jar-plugin to 3.2.0
- maven-javadoc-plugin to 3.3.1
- maven-jxr-plugin to 3.1.1
- maven-pmd-plugin to 3.15.0
- maven-project-info-reports-plugin to 3.1.2
- maven-resources-plugin to 3.2.0
- maven-shade-plugin to 3.2.4
- maven-site-plugin to 3.9.1
- maven-source-plugin to 3.2.1
- maven-surefire-plugin to 3.0.0-M5
- spotbugs-maven-plugin to 4.3.0
- tycho and tycho-extras to 1.7.0

Change-Id: I7738fbfd7db60ddbeb372efcb4c72c71112ac231

Ignore missing javadoc in test bundles

Change-Id: I83ed20823dc6b22ff48c2a554acb2f7d3b6067b7
(cherry picked from commit 12f39c26b09bc3ebf1dd0216f56c37c808a53034)

storage: file: De-duplicate File.exists()+File.isFile()

File.isFile() [1] checks if the file exists and is a normal file.

[1] https://docs.oracle.com/javase/8/docs/api/java/io/File.html#isFile--

Change-Id: I0a883f2482ecc5ac58b270351b416742b568eb68
Signed-off-by: Nasser Grainawi <quic_nasserg@quicinc.com>

RefDirectory.scanRef: Re-use file existence check done in snapshot creation

Return immediately in scanRef if the loose ref was identified as
missing when a snapshot was attempted for the ref. This will help
performance of scanRef when the ref is packed but has a corresponding
empty dir in 'refs/'.

For example, consider the case where we create 50k sharded refs in
a new namespace called 'new-refs' using an atomic 'BatchRefUpdate'.
The refs are named like 'refs/new-refs/01/1/1', 'refs/new-refs/01/1/2',
'refs/new-refs/01/1/3' and so on. After the refs are created, the
'new-refs' namespace looks like below:

$ find refs/new-refs -type f | wc -l
0

$ find refs/new-refs -type d | wc -l
5101

At this point, an 'exactRef' call on each of the 50k refs without
this change takes ~2.5s, where as with this change it takes ~1.5s.

Change-Id: I926bc41b9ae89a1a792b1b5ec9a17b05271c906b
Signed-off-by: Kaushik Lingarkar <quic_kaushikl@quicinc.com>

FileSnapshot: Lazy load file store attributes cache

Doing a getFileStoreAttributes call even when the file doesn't
exist is unnecessary. This call is particularly slow on some
filesystems. Instead, do it only when the file exists and load
the appropriate cache.

This update can help speed up RefDirectory.exactRef when the ref
is packed, but has a corresponding empty dir for it under 'refs/'.
This scenario can happen when an atomic 'BatchRefUpdate' creates
new sharded refs.

For example, consider the case where we create 50k sharded refs in
a new namespace called 'new-refs' using an atomic 'BatchRefUpdate'.
The refs are named like 'refs/new-refs/01/1/1', 'refs/new-refs/01/1/2',
'refs/new-refs/01/1/3' and so on. After the refs are created, the
'new-refs' namespace looks like below:

$ find refs/new-refs -type f | wc -l
0

$ find refs/new-refs -type d | wc -l
5101

At this point, an 'exactRef' call on each of the 50k refs without
this change takes ~30s, where as with this change it takes ~2.5s.

Change-Id: I4a5d4c6a652dbeed1f4bc3b4f2b2f1416f7ca0e7
Signed-off-by: Kaushik Lingarkar <quic_kaushikl@quicinc.com>

Update eclipse-jarsigner-plugin to 1.3.2

Change-Id: Id5d05d96c392913de7b4451421c2ffb7b63ab83f
(cherry picked from commit c70c0acb4752f00672e3b856539587e4977bfaea)

Fix p2 repository URLs

- the old jetty releases were moved to the archive server
- use https
- use eclipse 4.9 release repository

Change-Id: I2ca20dd828a9272a383e166e6ad82390415891cf

Merge branch 'stable-6.0'

* stable-6.0:
  Add o.e.j.ssh.apache.agent to maven central deployment scripts

Change-Id: I5685d6b3260c269fdcc0625fd0506a1ccd71d4b4

Add o.e.j.ssh.apache.agent to maven central deployment scripts

Change-Id: I3310eacafa83482191021beddd376d50c0a72775

Merge branch 'stable-6.0'

* stable-6.0:
  Prepare 6.0.1-SNAPSHOT builds
  JGit v6.0.0.202111291000-r
  Don't block in GC#gc until garbage collection finished

Change-Id: Ibdbcea607000621bf974b56a7399383d1372ce21

Prepare 6.0.1-SNAPSHOT builds

Change-Id: Iddb67ed9578293b83b8147aa18dd8319426f83d1

JGit v6.0.0.202111291000-r

Change-Id: I6441d9226e8131552bfafe1fb2c353f2e07e42ac
Signed-off-by: Matthias Sohn <matthias.sohn@sap.com>

Don't block in GC#gc until garbage collection finished

Let GC#gc return collection of newly created packs as CompletableFuture
to enable using gc() asynchronously.

Change-Id: I3627014fd458c738cfe54225e631d6f7d9cfb1a7

Merge branch 'stable-6.0'

* stable-6.0:
  FS: debug logging only if system config file cannot be found
  FS: debug logging only if system config file cannot be found
  Update .factorypath used by annotation processor for benchmarks
  Use  maven-compiler-plugin's release tag instead of source and target
  Don't use deprecated Repository#getAllRefs in Repository
  Don't use deprecated Repository#getAllRefs in FileRepository
  RevListTest: fix warning that method parameter hides field 'git'
  Implement RecordingLogger based on org.slf4j.Logger
  Let ObjectDatabase implement AutoClosable

Change-Id: Ie6b3cfa66b319033d4448dcf20362b753c0e9d7c

Merge branch 'stable-5.13' into stable-6.0

* stable-5.13:
  FS: debug logging only if system config file cannot be found

Change-Id: I4759e8ce2c26db74959a16b4129534e419ba988e

Merge branch 'stable-5.12' into stable-5.13

* stable-5.12:
  FS: debug logging only if system config file cannot be found

Change-Id: I4f6fd422e15361118134c4d1534507e0bd81a172

Merge branch 'stable-5.11' into stable-5.12

* stable-5.11:
  FS: debug logging only if system config file cannot be found

Change-Id: Ib32079d58900328f9fc7c91648a1eee9c2bccba5

Merge branch 'stable-5.10' into stable-5.11

* stable-5.10:
  FS: debug logging only if system config file cannot be found

Change-Id: Icd52afc3a74e0d2618181f62515d7e2a8d6c9739

Merge branch 'stable-5.9' into stable-5.10

* stable-5.9:
  FS: debug logging only if system config file cannot be found

Change-Id: Ib9eb4f4cc44ecc1958c9b6455ab7865913f8b247

FS: debug logging only if system config file cannot be found

The command 'git config --system --show-origin --list -z' fails if
the system config doesn't exist. Use debug logging instead of a
warning for failures of that command. Typically the user cannot do
anything about it anyway, and JGit will just work without system
config.

Bug: 577492
Change-Id: If628ab376182183aea57a385c169e144d371bbb2
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

FS: debug logging only if system config file cannot be found

The command 'git config --system --show-origin --list -z' fails if
the system config doesn't exist. Use debug logging instead of a
warning for failures of that command. Typically the user cannot do
anything about it anyway, and JGit will just work without system
config.

Bug: 577492
Change-Id: If628ab376182183aea57a385c169e144d371bbb2
Signed-off-by: Thomas Wolf <thomas.wolf@paranor.ch>

Update .factorypath used by annotation processor for benchmarks

Change-Id: Idd2c4760d81aa61643ef15292f1736a649be30b5

Use  maven-compiler-plugin's release tag instead of source and target

Change-Id: I090c8d074ae391a0721036bdc44e43c292a80963

Fix MANIFEST.MF of org.eclipse.jgit to correctly export packages:

org.eclipse.jgit.internal.diffmergetool
org.eclipse.jgit.internal.fsck

This was broken with changes for bug 356832.

Bug: 356832
Change-Id: Id008d058769b4923d545a9373b45ceb3a3d27a08
Signed-off-by: Simeon Andreev <simeon.danailov.andreev@gmail.com>