SONAR-6214 Document parameter 's' of api/users/search

Automatic merge from master

* origin/master:
  SONAR-5884 update coverage tooltips
  Fix quality flaws
  Fix indexing of issues -> mix functional and technical dates
  SONAR-4624 Add "won't fix" in the Administer Issues permission
  SONAR-6055 Embed latest Java 3.0 plugin and stop embedding Findbugs Plugin

SONAR-5884 update coverage tooltips

Fix quality flaws

Fix indexing of issues -> mix functional and technical dates

SONAR-4624 Add "won't fix" in the Administer Issues permission

SONAR-6055 Embed latest Java 3.0 plugin and stop embedding Findbugs Plugin

Automatic merge from master

* origin/master:
  SONAR-6229 fix indexing of active rules

SONAR-6229 fix indexing of active rules

Automatic merge from master

* origin/master:
  SONAR-5945 close issues on deleted components
  Fix error margin of SourceDbBenchmarkTest
  Fix error margin of server benchmark
  Fix Javadoc and add useful method using Charset for RulesDefinitionXmlLoader

SONAR-5945 close issues on deleted components

Fix error margin of SourceDbBenchmarkTest

Fix error margin of server benchmark

Fix Javadoc and add useful method using Charset for RulesDefinitionXmlLoader

Automatic merge from master

* origin/master:
  SONAR-6229 incremental indexing
  Remove unused BulkIndexer#setRefresh(boolean)
  Upgrade Elasticsearch from 1.4.2 to 1.4.4
  SONAR-6229 improve performance of ES indexing at startup
  Allow views to save any measure for remote views copy
  Document method to avoid nasty side effects on Views
  Async replication of activity docs

SONAR-6234 fix widget name

add missed file headers

SONAR-6229 incremental indexing

SONAR-5726 SONAR-6234 cover some corner cases, add tests

Remove unused BulkIndexer#setRefresh(boolean)

Upgrade Elasticsearch from 1.4.2 to 1.4.4

SONAR-6229 improve performance of ES indexing at startup

add some tests of the component viewer

generate js coverage report from casperjs tests

SONAR-6234 add project issue filter widget

SONAR-5726 add global issue filter widget

fix quality flaws

Allow views to save any measure for remote views copy

Document method to avoid nasty side effects on Views

Async replication of activity docs

Automatic merge from master

* origin/master:
  Improve assertions in server benchmarks
  update shortcuts help labels
  Fix compatibility of tests with Oracle

Improve assertions in server benchmarks

update shortcuts help labels

Fix compatibility of tests with Oracle

add information to the "New Issues" notification - SONAR-6045

Automatic merge from master

* origin/master:
  Fix compatibility of tests with non-H2 dbs
  SONAR-6229 Indexing of activity logs consumes too much memory during server startup
  SONAR-6233 fix characteristic facet on rules page
  SONAR-6233 Fix behavior of facet on uncharacterized rules
  SONAR-6238 Updating only the name of a rule is not taking in account when synchronizing rules at startup
  Update javadoc
  Rename method
  Add javadoc
  change "recent history" to "browsed recently"

Fix compatibility of tests with non-H2 dbs

SONAR-6229 Indexing of activity logs consumes too much memory during server startup

SONAR-6233 fix characteristic facet on rules page

SONAR-6233 Fix behavior of facet on uncharacterized rules

SONAR-6238 Updating only the name of a rule is not taking in account when synchronizing rules at startup

Update javadoc

Rename method

Add javadoc

change "recent history" to "browsed recently"

Automatic merge from master

* origin/master:
  fix source viewer test
  Add search the ability to search for rules by profiles in RubyRuleService Needed to fix SQALE-269
  SONAR-5884 show ut and it coverage separately
  SONAR-5884 show ut and it coverage separately
  SONAR-5884 Apply feedback on unit test and field names
  SONAR-5884 Replace overall coverage with UT coverage, add IT coverage info
  Revert "SONAR-6202 Compute overall coverage on all files"
  SONAR-5077 Display ncloc of files with no language in size widget
  SONAR-6233 Searching for rules without debt characteristic is not working
  fix bug with extra duplicated line in the popup
  fix bug with extra duplicated line
  Fix quality flaws
  update events widget
  Update version of Git and SVN plugins to 1.0

SONAR-6123 Show js tooltips for bubble chart instead of text before the chart

fix source viewer test

Add search the ability to search for rules by profiles in RubyRuleService
Needed to fix SQALE-269

SONAR-5884 show ut and it coverage separately

SONAR-5884 show ut and it coverage separately

SONAR-5884 Apply feedback on unit test and field names

SONAR-5884 Replace overall coverage with UT coverage, add IT coverage info

Revert "SONAR-6202 Compute overall coverage on all files"

This reverts commit eac465bea9f5bf89a7beb8036e4d8eea4723f421.

Conflicts:
plugins/sonar-core-plugin/src/main/java/org/sonar/plugins/core/CorePlugin.java

SONAR-5077 Display ncloc of files with no language in size widget

SONAR-6233 Searching for rules without debt characteristic is not working

fix bug with extra duplicated line in the popup

fix bug with extra duplicated line

Fix quality flaws

fix merge 5.2

update events widget

Update version of Git and SVN plugins to 1.0

Merge remote-tracking branch 'origin/master' into branch-5.2

Conflicts:
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/computation/ComputationContext.java
server/sonar-server/src/main/java/org/sonar/server/computation/ComputationService.java
server/sonar-server/src/test/java/org/sonar/server/computation/ComputationServiceTest.java
server/sonar-server/src/test/java/org/sonar/server/computation/step/ParseReportStepTest.java
server/sonar-server/src/test/java/org/sonar/server/computation/step/PurgeDatastoresStepMediumTest.java
server/sonar-server/src/test/java/org/sonar/server/computation/step/PurgeDatastoresStepTest.java

show rule's issues in the same tab

update help window

Refactor table ANALYSIS_REPORTS because of MySQL packet size limitation

* do not store report zip in table ANALYSIS_REPORTS but in FS dir {home}/data/analysis
* do not store snapshot id in table but in protobuf report

Automatic merge from master

* origin/master:
  Test internal Git merge tool

Test internal Git merge tool

SONAR-6155 upgrade selection of users

add new user type property settings - server side - SONAR-6155

Allow to set a default assignee on issues (2nd edition) - SONAR-6154

integrates my last 3 commits as the merge broke previous commit on branch-5.2

Update pom to 5.2-SNAPSHOT

Merge remote-tracking branch 'origin/master' into branch-5.2

SONAR-6222 SQALE Rating is badly render in the timeline widget

Merge branch 'master' into branch-5.1

revert back to 5.2-SNAPSHOT after job generation

switch version to 5.1 for regeneration of jenkins job

fix connection leak

fix default assignee when property is null - SONAR-6154

fix component wrapping on issues page

sort extra measures categories by name

fix deletion of scm accounts

Allow to set a default assignee on issues - SONAR-6154

Rename a migration because the name is too long on windows

Automatic merge from branch-5.1

* origin/branch-5.1:
  SONAR-6012 Push forgotten update of batch input proto
  SONAR-6075 Hide projects and authors facets on a developer technical project
  Increase reliability of ProgressLoggerTest on slow machines

Merge branch 'branch-5.0' into branch-5.1

SONAR-6012 Push forgotten update of batch input proto

SONAR-6075 Hide projects and authors facets on a developer technical project

Upgrade version to 5.2-SNAPSHOT

SONAR-5927 Blacklist the build breaker plugin in preview mode

SONAR-5927 Fix 404 when analyzing new file

SONAR-6012 Checksum can be null

Fix some quality flaws

Fix quality flaw

SONAR-5927, SONAR-6012 Rework incremental preview mode to speedup issue retrieval

Fix typo

add combined dev&watch grunt task

add web assets headers

Increase reliability of ProgressLoggerTest on slow machines

Increase reliability of ProgressLoggerTest on slow machines